Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDS7

Uncharacterized protein C21orf140 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8CDS7 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8CDS7 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8CDS7 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8CDS7 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8CDS7 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8CDS7 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8CDS7 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8CDS7 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8CDS7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q8CDS7 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q8CDS7 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q8CDS7 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q8CDS7 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q8CDS7 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q8CDS7 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q8CDS7 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q8CDS7 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Q8CDS7 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q8CDS7 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q8CDS7 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Q8CDS7 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q8CDS7 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q8CDS7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q8CDS7 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q8CDS7 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q8CDS7 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8CDS7 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8CDS7 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8CDS7 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8CDS7 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8CDS7 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8CDS7 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8CDS7 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8CDS7 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8CDS7 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8CDS7 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8CDS7 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8CDS7 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8CDS7 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8CDS7 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8CDS7 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8CDS7 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8CDS7 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8CDS7 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8CDS7 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8CDS7 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8CDS7 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8CDS7 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8CDS7 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8CDS7 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q8CDS7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q8CDS7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q8CDS7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q8CDS7 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Q8CDS7 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q8CDS7 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q8CDS7 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q8CDS7 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q8CDS7 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q8CDS7 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q8CDS7 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q8CDS7 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q8CDS7 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Q8CDS7 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q8CDS7 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q8CDS7 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q8CDS7 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q8CDS7 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Q8CDS7 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8CDS7 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8CDS7 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8CDS7 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8CDS7 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8CDS7 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8CDS7 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8CDS7 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8CDS7 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8CDS7 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8CDS7 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8CDS7 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8CDS7 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8CDS7 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8CDS7 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8CDS7 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q8CDS7 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8CDS7 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8CDS7 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8CDS7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8CDS7 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8CDS7 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8CDS7 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8CDS7 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8CDS7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8CDS7 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8CDS7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8CDS7 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8CDS7 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q8CDS7 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8CDS7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q8CDS7 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms