Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Lrrc9Q8CDN9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Lrrc9Q8CDN9 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Lrrc9Q8CDN9 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Lrrc9Q8CDN9 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Lrrc9Q8CDN9 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Lrrc9Q8CDN9 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Lrrc9Q8CDN9 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Lrrc9Q8CDN9 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Lrrc9Q8CDN9 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Lrrc9Q8CDN9 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Lrrc9Q8CDN9 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Lrrc9Q8CDN9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Lrrc9Q8CDN9 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Lrrc9Q8CDN9 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Lrrc9Q8CDN9 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Lrrc9Q8CDN9 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Lrrc9Q8CDN9 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Lrrc9Q8CDN9 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Lrrc9Q8CDN9 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Lrrc9Q8CDN9 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Lrrc9Q8CDN9 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Lrrc9Q8CDN9 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Lrrc9Q8CDN9 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Lrrc9Q8CDN9 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Lrrc9Q8CDN9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Lrrc9Q8CDN9 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Lrrc9Q8CDN9 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Lrrc9Q8CDN9 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Lrrc9Q8CDN9 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Lrrc9Q8CDN9 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Lrrc9Q8CDN9 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Lrrc9Q8CDN9 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Lrrc9Q8CDN9 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Lrrc9Q8CDN9 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Lrrc9Q8CDN9 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Lrrc9Q8CDN9 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Lrrc9Q8CDN9 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Lrrc9Q8CDN9 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Lrrc9Q8CDN9 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Lrrc9Q8CDN9 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Lrrc9Q8CDN9 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Lrrc9Q8CDN9 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Lrrc9Q8CDN9 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Lrrc9Q8CDN9 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Lrrc9Q8CDN9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Lrrc9Q8CDN9 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Lrrc9Q8CDN9 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Lrrc9Q8CDN9 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Lrrc9Q8CDN9 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Lrrc9Q8CDN9 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Lrrc9Q8CDN9 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Lrrc9Q8CDN9 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Lrrc9Q8CDN9 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Lrrc9Q8CDN9 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Lrrc9Q8CDN9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Lrrc9Q8CDN9 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Lrrc9Q8CDN9 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Lrrc9Q8CDN9 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Lrrc9Q8CDN9 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Lrrc9Q8CDN9 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Lrrc9Q8CDN9 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Lrrc9Q8CDN9 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Lrrc9Q8CDN9 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Lrrc9Q8CDN9 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Lrrc9Q8CDN9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Lrrc9Q8CDN9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Lrrc9Q8CDN9 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Lrrc9Q8CDN9 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Lrrc9Q8CDN9 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Lrrc9Q8CDN9 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Lrrc9Q8CDN9 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Lrrc9Q8CDN9 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Lrrc9Q8CDN9 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Lrrc9Q8CDN9 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Lrrc9Q8CDN9 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Lrrc9Q8CDN9 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Lrrc9Q8CDN9 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Lrrc9Q8CDN9 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Lrrc9Q8CDN9 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Lrrc9Q8CDN9 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Lrrc9Q8CDN9 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Lrrc9Q8CDN9 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Lrrc9Q8CDN9 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Lrrc9Q8CDN9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Lrrc9Q8CDN9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Lrrc9Q8CDN9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Lrrc9Q8CDN9 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Lrrc9Q8CDN9 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Lrrc9Q8CDN9 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Lrrc9Q8CDN9 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Lrrc9Q8CDN9 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Lrrc9Q8CDN9 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Lrrc9Q8CDN9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Lrrc9Q8CDN9 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Lrrc9Q8CDN9 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Lrrc9Q8CDN9 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Lrrc9Q8CDN9 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Lrrc9Q8CDN9 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Lrrc9Q8CDN9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms