Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDE2

Ccin, Calicin, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcinQ8CDE2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CcinQ8CDE2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CcinQ8CDE2 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CcinQ8CDE2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CcinQ8CDE2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CcinQ8CDE2 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CcinQ8CDE2 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CcinQ8CDE2 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CcinQ8CDE2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CcinQ8CDE2 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CcinQ8CDE2 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CcinQ8CDE2 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CcinQ8CDE2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CcinQ8CDE2 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CcinQ8CDE2 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CcinQ8CDE2 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CcinQ8CDE2 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CcinQ8CDE2 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CcinQ8CDE2 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CcinQ8CDE2 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CcinQ8CDE2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CcinQ8CDE2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CcinQ8CDE2 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CcinQ8CDE2 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CcinQ8CDE2 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CcinQ8CDE2 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CcinQ8CDE2 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CcinQ8CDE2 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CcinQ8CDE2 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CcinQ8CDE2 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CcinQ8CDE2 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CcinQ8CDE2 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CcinQ8CDE2 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CcinQ8CDE2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CcinQ8CDE2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CcinQ8CDE2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CcinQ8CDE2 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CcinQ8CDE2 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CcinQ8CDE2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CcinQ8CDE2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CcinQ8CDE2 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CcinQ8CDE2 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CcinQ8CDE2 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CcinQ8CDE2 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CcinQ8CDE2 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CcinQ8CDE2 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CcinQ8CDE2 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CcinQ8CDE2 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CcinQ8CDE2 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CcinQ8CDE2 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CcinQ8CDE2 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CcinQ8CDE2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CcinQ8CDE2 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CcinQ8CDE2 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CcinQ8CDE2 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CcinQ8CDE2 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CcinQ8CDE2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CcinQ8CDE2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CcinQ8CDE2 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CcinQ8CDE2 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CcinQ8CDE2 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CcinQ8CDE2 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CcinQ8CDE2 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CcinQ8CDE2 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CcinQ8CDE2 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CcinQ8CDE2 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CcinQ8CDE2 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CcinQ8CDE2 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CcinQ8CDE2 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CcinQ8CDE2 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CcinQ8CDE2 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CcinQ8CDE2 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CcinQ8CDE2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CcinQ8CDE2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CcinQ8CDE2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CcinQ8CDE2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CcinQ8CDE2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CcinQ8CDE2 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CcinQ8CDE2 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CcinQ8CDE2 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CcinQ8CDE2 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CcinQ8CDE2 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CcinQ8CDE2 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CcinQ8CDE2 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CcinQ8CDE2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CcinQ8CDE2 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CcinQ8CDE2 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CcinQ8CDE2 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CcinQ8CDE2 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CcinQ8CDE2 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CcinQ8CDE2 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CcinQ8CDE2 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CcinQ8CDE2 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CcinQ8CDE2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CcinQ8CDE2 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CcinQ8CDE2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CcinQ8CDE2 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CcinQ8CDE2 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CcinQ8CDE2 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CcinQ8CDE2 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms