Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCI5

Rybp, RING1 and YY1-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RybpQ8CCI5 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RybpQ8CCI5 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RybpQ8CCI5 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RybpQ8CCI5 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RybpQ8CCI5 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RybpQ8CCI5 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RybpQ8CCI5 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RybpQ8CCI5 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RybpQ8CCI5 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RybpQ8CCI5 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RybpQ8CCI5 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RybpQ8CCI5 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RybpQ8CCI5 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RybpQ8CCI5 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RybpQ8CCI5 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RybpQ8CCI5 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RybpQ8CCI5 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RybpQ8CCI5 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RybpQ8CCI5 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RybpQ8CCI5 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RybpQ8CCI5 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RybpQ8CCI5 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RybpQ8CCI5 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RybpQ8CCI5 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RybpQ8CCI5 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RybpQ8CCI5 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RybpQ8CCI5 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RybpQ8CCI5 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RybpQ8CCI5 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RybpQ8CCI5 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RybpQ8CCI5 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RybpQ8CCI5 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RybpQ8CCI5 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RybpQ8CCI5 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RybpQ8CCI5 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RybpQ8CCI5 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RybpQ8CCI5 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RybpQ8CCI5 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RybpQ8CCI5 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RybpQ8CCI5 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RybpQ8CCI5 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RybpQ8CCI5 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RybpQ8CCI5 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RybpQ8CCI5 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RybpQ8CCI5 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RybpQ8CCI5 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RybpQ8CCI5 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RybpQ8CCI5 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RybpQ8CCI5 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RybpQ8CCI5 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RybpQ8CCI5 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RybpQ8CCI5 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RybpQ8CCI5 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RybpQ8CCI5 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RybpQ8CCI5 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RybpQ8CCI5 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RybpQ8CCI5 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RybpQ8CCI5 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RybpQ8CCI5 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RybpQ8CCI5 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RybpQ8CCI5 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RybpQ8CCI5 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RybpQ8CCI5 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RybpQ8CCI5 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RybpQ8CCI5 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RybpQ8CCI5 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RybpQ8CCI5 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RybpQ8CCI5 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RybpQ8CCI5 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RybpQ8CCI5 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RybpQ8CCI5 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RybpQ8CCI5 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RybpQ8CCI5 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RybpQ8CCI5 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RybpQ8CCI5 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RybpQ8CCI5 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RybpQ8CCI5 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RybpQ8CCI5 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RybpQ8CCI5 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RybpQ8CCI5 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RybpQ8CCI5 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RybpQ8CCI5 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
RybpQ8CCI5 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RybpQ8CCI5 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RybpQ8CCI5 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RybpQ8CCI5 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RybpQ8CCI5 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
RybpQ8CCI5 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RybpQ8CCI5 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RybpQ8CCI5 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RybpQ8CCI5 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RybpQ8CCI5 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RybpQ8CCI5 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RybpQ8CCI5 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RybpQ8CCI5 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RybpQ8CCI5 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RybpQ8CCI5 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RybpQ8CCI5 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RybpQ8CCI5 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RybpQ8CCI5 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms