Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nhlrc3Q8CCH2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Nhlrc3Q8CCH2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nhlrc3Q8CCH2 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nhlrc3Q8CCH2 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhlrc3Q8CCH2 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhlrc3Q8CCH2 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhlrc3Q8CCH2 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhlrc3Q8CCH2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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