Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBD1

Nrip1, Nuclear receptor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip1Q8CBD1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nrip1Q8CBD1 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nrip1Q8CBD1 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nrip1Q8CBD1 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Nrip1Q8CBD1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nrip1Q8CBD1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nrip1Q8CBD1 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nrip1Q8CBD1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nrip1Q8CBD1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nrip1Q8CBD1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nrip1Q8CBD1 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nrip1Q8CBD1 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nrip1Q8CBD1 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Nrip1Q8CBD1 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nrip1Q8CBD1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nrip1Q8CBD1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nrip1Q8CBD1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nrip1Q8CBD1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nrip1Q8CBD1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nrip1Q8CBD1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nrip1Q8CBD1 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nrip1Q8CBD1 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nrip1Q8CBD1 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nrip1Q8CBD1 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nrip1Q8CBD1 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nrip1Q8CBD1 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Nrip1Q8CBD1 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nrip1Q8CBD1 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nrip1Q8CBD1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nrip1Q8CBD1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nrip1Q8CBD1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nrip1Q8CBD1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nrip1Q8CBD1 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Nrip1Q8CBD1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nrip1Q8CBD1 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nrip1Q8CBD1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nrip1Q8CBD1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nrip1Q8CBD1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nrip1Q8CBD1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nrip1Q8CBD1 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Nrip1Q8CBD1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nrip1Q8CBD1 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nrip1Q8CBD1 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nrip1Q8CBD1 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nrip1Q8CBD1 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nrip1Q8CBD1 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nrip1Q8CBD1 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nrip1Q8CBD1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nrip1Q8CBD1 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nrip1Q8CBD1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nrip1Q8CBD1 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nrip1Q8CBD1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nrip1Q8CBD1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nrip1Q8CBD1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nrip1Q8CBD1 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nrip1Q8CBD1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nrip1Q8CBD1 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Nrip1Q8CBD1 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nrip1Q8CBD1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nrip1Q8CBD1 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nrip1Q8CBD1 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nrip1Q8CBD1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nrip1Q8CBD1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nrip1Q8CBD1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Nrip1Q8CBD1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nrip1Q8CBD1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nrip1Q8CBD1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nrip1Q8CBD1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nrip1Q8CBD1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nrip1Q8CBD1 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nrip1Q8CBD1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nrip1Q8CBD1 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nrip1Q8CBD1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Nrip1Q8CBD1 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nrip1Q8CBD1 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nrip1Q8CBD1 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nrip1Q8CBD1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nrip1Q8CBD1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nrip1Q8CBD1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nrip1Q8CBD1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nrip1Q8CBD1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nrip1Q8CBD1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nrip1Q8CBD1 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nrip1Q8CBD1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nrip1Q8CBD1 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nrip1Q8CBD1 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nrip1Q8CBD1 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nrip1Q8CBD1 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nrip1Q8CBD1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nrip1Q8CBD1 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nrip1Q8CBD1 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Nrip1Q8CBD1 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nrip1Q8CBD1 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nrip1Q8CBD1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nrip1Q8CBD1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nrip1Q8CBD1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nrip1Q8CBD1 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nrip1Q8CBD1 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nrip1Q8CBD1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nrip1Q8CBD1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms