Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atg4aQ8C9S8 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atg4aQ8C9S8 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atg4aQ8C9S8 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atg4aQ8C9S8 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atg4aQ8C9S8 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atg4aQ8C9S8 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atg4aQ8C9S8 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atg4aQ8C9S8 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atg4aQ8C9S8 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg4aQ8C9S8 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg4aQ8C9S8 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg4aQ8C9S8 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg4aQ8C9S8 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg4aQ8C9S8 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg4aQ8C9S8 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg4aQ8C9S8 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg4aQ8C9S8 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atg4aQ8C9S8 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atg4aQ8C9S8 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atg4aQ8C9S8 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atg4aQ8C9S8 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atg4aQ8C9S8 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atg4aQ8C9S8 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Atg4aQ8C9S8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atg4aQ8C9S8 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atg4aQ8C9S8 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atg4aQ8C9S8 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atg4aQ8C9S8 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atg4aQ8C9S8 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atg4aQ8C9S8 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atg4aQ8C9S8 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atg4aQ8C9S8 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atg4aQ8C9S8 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atg4aQ8C9S8 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atg4aQ8C9S8 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atg4aQ8C9S8 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atg4aQ8C9S8 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atg4aQ8C9S8 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
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Atg4aQ8C9S8 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atg4aQ8C9S8 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atg4aQ8C9S8 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Atg4aQ8C9S8 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atg4aQ8C9S8 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atg4aQ8C9S8 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atg4aQ8C9S8 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atg4aQ8C9S8 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atg4aQ8C9S8 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atg4aQ8C9S8 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atg4aQ8C9S8 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atg4aQ8C9S8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atg4aQ8C9S8 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atg4aQ8C9S8 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atg4aQ8C9S8 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atg4aQ8C9S8 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atg4aQ8C9S8 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atg4aQ8C9S8 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Atg4aQ8C9S8 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Atg4aQ8C9S8 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Atg4aQ8C9S8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
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Atg4aQ8C9S8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atg4aQ8C9S8 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atg4aQ8C9S8 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atg4aQ8C9S8 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atg4aQ8C9S8 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Atg4aQ8C9S8 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atg4aQ8C9S8 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atg4aQ8C9S8 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atg4aQ8C9S8 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atg4aQ8C9S8 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atg4aQ8C9S8 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atg4aQ8C9S8 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atg4aQ8C9S8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atg4aQ8C9S8 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atg4aQ8C9S8 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atg4aQ8C9S8 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atg4aQ8C9S8 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atg4aQ8C9S8 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atg4aQ8C9S8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atg4aQ8C9S8 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atg4aQ8C9S8 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atg4aQ8C9S8 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atg4aQ8C9S8 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atg4aQ8C9S8 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atg4aQ8C9S8 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atg4aQ8C9S8 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atg4aQ8C9S8 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
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