Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9J3

Spef2, Sperm flagellar protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spef2Q8C9J3 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Spef2Q8C9J3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Spef2Q8C9J3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Spef2Q8C9J3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Spef2Q8C9J3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Spef2Q8C9J3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Spef2Q8C9J3 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Spef2Q8C9J3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Spef2Q8C9J3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Spef2Q8C9J3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Spef2Q8C9J3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Spef2Q8C9J3 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Spef2Q8C9J3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Spef2Q8C9J3 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Spef2Q8C9J3 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Spef2Q8C9J3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Spef2Q8C9J3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Spef2Q8C9J3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Spef2Q8C9J3 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Spef2Q8C9J3 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Spef2Q8C9J3 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Spef2Q8C9J3 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Spef2Q8C9J3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Spef2Q8C9J3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Spef2Q8C9J3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Spef2Q8C9J3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Spef2Q8C9J3 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Spef2Q8C9J3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Spef2Q8C9J3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Spef2Q8C9J3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Spef2Q8C9J3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Spef2Q8C9J3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Spef2Q8C9J3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Spef2Q8C9J3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Spef2Q8C9J3 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Spef2Q8C9J3 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Spef2Q8C9J3 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Spef2Q8C9J3 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Spef2Q8C9J3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Spef2Q8C9J3 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Spef2Q8C9J3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Spef2Q8C9J3 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Spef2Q8C9J3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Spef2Q8C9J3 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Spef2Q8C9J3 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Spef2Q8C9J3 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Spef2Q8C9J3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Spef2Q8C9J3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Spef2Q8C9J3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Spef2Q8C9J3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Spef2Q8C9J3 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Spef2Q8C9J3 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Spef2Q8C9J3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Spef2Q8C9J3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Spef2Q8C9J3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Spef2Q8C9J3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Spef2Q8C9J3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Spef2Q8C9J3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Spef2Q8C9J3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Spef2Q8C9J3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Spef2Q8C9J3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Spef2Q8C9J3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Spef2Q8C9J3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Spef2Q8C9J3 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Spef2Q8C9J3 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Spef2Q8C9J3 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Spef2Q8C9J3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Spef2Q8C9J3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Spef2Q8C9J3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Spef2Q8C9J3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Spef2Q8C9J3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Spef2Q8C9J3 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Spef2Q8C9J3 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Spef2Q8C9J3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Spef2Q8C9J3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Spef2Q8C9J3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Spef2Q8C9J3 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Spef2Q8C9J3 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Spef2Q8C9J3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Spef2Q8C9J3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Spef2Q8C9J3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Spef2Q8C9J3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Spef2Q8C9J3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Spef2Q8C9J3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Spef2Q8C9J3 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Spef2Q8C9J3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Spef2Q8C9J3 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Spef2Q8C9J3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Spef2Q8C9J3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Spef2Q8C9J3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Spef2Q8C9J3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Spef2Q8C9J3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Spef2Q8C9J3 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Spef2Q8C9J3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Spef2Q8C9J3 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Spef2Q8C9J3 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Spef2Q8C9J3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Spef2Q8C9J3 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Spef2Q8C9J3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Spef2Q8C9J3 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms