Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7W7

Dclre1b, 5' exonuclease Apollo, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclre1bQ8C7W7 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dclre1bQ8C7W7 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dclre1bQ8C7W7 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dclre1bQ8C7W7 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Dclre1bQ8C7W7 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dclre1bQ8C7W7 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dclre1bQ8C7W7 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dclre1bQ8C7W7 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dclre1bQ8C7W7 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dclre1bQ8C7W7 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dclre1bQ8C7W7 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dclre1bQ8C7W7 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dclre1bQ8C7W7 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dclre1bQ8C7W7 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dclre1bQ8C7W7 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dclre1bQ8C7W7 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dclre1bQ8C7W7 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dclre1bQ8C7W7 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dclre1bQ8C7W7 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dclre1bQ8C7W7 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dclre1bQ8C7W7 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dclre1bQ8C7W7 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Dclre1bQ8C7W7 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dclre1bQ8C7W7 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dclre1bQ8C7W7 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dclre1bQ8C7W7 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dclre1bQ8C7W7 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dclre1bQ8C7W7 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dclre1bQ8C7W7 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dclre1bQ8C7W7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dclre1bQ8C7W7 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dclre1bQ8C7W7 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dclre1bQ8C7W7 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dclre1bQ8C7W7 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dclre1bQ8C7W7 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dclre1bQ8C7W7 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dclre1bQ8C7W7 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dclre1bQ8C7W7 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dclre1bQ8C7W7 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dclre1bQ8C7W7 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dclre1bQ8C7W7 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dclre1bQ8C7W7 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dclre1bQ8C7W7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dclre1bQ8C7W7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dclre1bQ8C7W7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dclre1bQ8C7W7 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dclre1bQ8C7W7 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Dclre1bQ8C7W7 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Dclre1bQ8C7W7 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Dclre1bQ8C7W7 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Dclre1bQ8C7W7 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Dclre1bQ8C7W7 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Dclre1bQ8C7W7 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Dclre1bQ8C7W7 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Dclre1bQ8C7W7 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Dclre1bQ8C7W7 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Dclre1bQ8C7W7 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dclre1bQ8C7W7 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dclre1bQ8C7W7 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Dclre1bQ8C7W7 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dclre1bQ8C7W7 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dclre1bQ8C7W7 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dclre1bQ8C7W7 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dclre1bQ8C7W7 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dclre1bQ8C7W7 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dclre1bQ8C7W7 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dclre1bQ8C7W7 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Dclre1bQ8C7W7 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dclre1bQ8C7W7 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dclre1bQ8C7W7 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dclre1bQ8C7W7 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dclre1bQ8C7W7 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dclre1bQ8C7W7 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dclre1bQ8C7W7 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dclre1bQ8C7W7 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dclre1bQ8C7W7 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dclre1bQ8C7W7 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dclre1bQ8C7W7 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dclre1bQ8C7W7 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dclre1bQ8C7W7 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dclre1bQ8C7W7 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dclre1bQ8C7W7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dclre1bQ8C7W7 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dclre1bQ8C7W7 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dclre1bQ8C7W7 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dclre1bQ8C7W7 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dclre1bQ8C7W7 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dclre1bQ8C7W7 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dclre1bQ8C7W7 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dclre1bQ8C7W7 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dclre1bQ8C7W7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dclre1bQ8C7W7 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dclre1bQ8C7W7 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dclre1bQ8C7W7 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dclre1bQ8C7W7 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dclre1bQ8C7W7 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dclre1bQ8C7W7 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dclre1bQ8C7W7 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dclre1bQ8C7W7 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dclre1bQ8C7W7 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms