Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Usp20Q8C6M1 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Usp20Q8C6M1 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Usp20Q8C6M1 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Usp20Q8C6M1 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Usp20Q8C6M1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Usp20Q8C6M1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Usp20Q8C6M1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Usp20Q8C6M1 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Usp20Q8C6M1 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Usp20Q8C6M1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Usp20Q8C6M1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Usp20Q8C6M1 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Usp20Q8C6M1 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp20Q8C6M1 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp20Q8C6M1 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp20Q8C6M1 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp20Q8C6M1 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp20Q8C6M1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp20Q8C6M1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp20Q8C6M1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp20Q8C6M1 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp20Q8C6M1 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp20Q8C6M1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp20Q8C6M1 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp20Q8C6M1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp20Q8C6M1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Usp20Q8C6M1 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Usp20Q8C6M1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Usp20Q8C6M1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Usp20Q8C6M1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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Usp20Q8C6M1 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Usp20Q8C6M1 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Usp20Q8C6M1 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Usp20Q8C6M1 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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Usp20Q8C6M1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Usp20Q8C6M1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Usp20Q8C6M1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Usp20Q8C6M1 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
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Usp20Q8C6M1 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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Usp20Q8C6M1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp20Q8C6M1 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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Usp20Q8C6M1 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp20Q8C6M1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp20Q8C6M1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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Usp20Q8C6M1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp20Q8C6M1 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp20Q8C6M1 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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Usp20Q8C6M1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp20Q8C6M1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp20Q8C6M1 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp20Q8C6M1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp20Q8C6M1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp20Q8C6M1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp20Q8C6M1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp20Q8C6M1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp20Q8C6M1 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp20Q8C6M1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp20Q8C6M1 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp20Q8C6M1 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp20Q8C6M1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp20Q8C6M1 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp20Q8C6M1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp20Q8C6M1 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp20Q8C6M1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp20Q8C6M1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp20Q8C6M1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp20Q8C6M1 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp20Q8C6M1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp20Q8C6M1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp20Q8C6M1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp20Q8C6M1 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp20Q8C6M1 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp20Q8C6M1 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
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Usp20Q8C6M1 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp20Q8C6M1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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