Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc113Q8C5T8 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc113Q8C5T8 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc113Q8C5T8 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc113Q8C5T8 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc113Q8C5T8 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc113Q8C5T8 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc113Q8C5T8 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc113Q8C5T8 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc113Q8C5T8 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc113Q8C5T8 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc113Q8C5T8 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc113Q8C5T8 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc113Q8C5T8 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc113Q8C5T8 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccdc113Q8C5T8 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccdc113Q8C5T8 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccdc113Q8C5T8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc113Q8C5T8 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc113Q8C5T8 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc113Q8C5T8 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc113Q8C5T8 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc113Q8C5T8 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc113Q8C5T8 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc113Q8C5T8 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc113Q8C5T8 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc113Q8C5T8 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc113Q8C5T8 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc113Q8C5T8 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc113Q8C5T8 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc113Q8C5T8 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc113Q8C5T8 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc113Q8C5T8 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc113Q8C5T8 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc113Q8C5T8 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc113Q8C5T8 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc113Q8C5T8 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc113Q8C5T8 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc113Q8C5T8 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc113Q8C5T8 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc113Q8C5T8 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc113Q8C5T8 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc113Q8C5T8 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc113Q8C5T8 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc113Q8C5T8 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc113Q8C5T8 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc113Q8C5T8 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc113Q8C5T8 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc113Q8C5T8 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc113Q8C5T8 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc113Q8C5T8 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc113Q8C5T8 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc113Q8C5T8 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc113Q8C5T8 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc113Q8C5T8 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc113Q8C5T8 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc113Q8C5T8 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc113Q8C5T8 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc113Q8C5T8 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc113Q8C5T8 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc113Q8C5T8 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc113Q8C5T8 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc113Q8C5T8 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc113Q8C5T8 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc113Q8C5T8 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc113Q8C5T8 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc113Q8C5T8 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc113Q8C5T8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc113Q8C5T8 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc113Q8C5T8 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc113Q8C5T8 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc113Q8C5T8 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc113Q8C5T8 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc113Q8C5T8 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc113Q8C5T8 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc113Q8C5T8 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc113Q8C5T8 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc113Q8C5T8 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc113Q8C5T8 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc113Q8C5T8 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc113Q8C5T8 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc113Q8C5T8 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc113Q8C5T8 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc113Q8C5T8 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc113Q8C5T8 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc113Q8C5T8 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc113Q8C5T8 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc113Q8C5T8 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc113Q8C5T8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc113Q8C5T8 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc113Q8C5T8 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc113Q8C5T8 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc113Q8C5T8 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc113Q8C5T8 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc113Q8C5T8 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc113Q8C5T8 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc113Q8C5T8 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc113Q8C5T8 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc113Q8C5T8 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc113Q8C5T8 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
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