Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4U3

Sfrp1, Secreted frizzled-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp1Q8C4U3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sfrp1Q8C4U3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sfrp1Q8C4U3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Sfrp1Q8C4U3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sfrp1Q8C4U3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sfrp1Q8C4U3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sfrp1Q8C4U3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sfrp1Q8C4U3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sfrp1Q8C4U3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sfrp1Q8C4U3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sfrp1Q8C4U3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sfrp1Q8C4U3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sfrp1Q8C4U3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Sfrp1Q8C4U3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sfrp1Q8C4U3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sfrp1Q8C4U3 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Sfrp1Q8C4U3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sfrp1Q8C4U3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sfrp1Q8C4U3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sfrp1Q8C4U3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sfrp1Q8C4U3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sfrp1Q8C4U3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sfrp1Q8C4U3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sfrp1Q8C4U3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sfrp1Q8C4U3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sfrp1Q8C4U3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sfrp1Q8C4U3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sfrp1Q8C4U3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sfrp1Q8C4U3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sfrp1Q8C4U3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sfrp1Q8C4U3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sfrp1Q8C4U3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sfrp1Q8C4U3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sfrp1Q8C4U3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sfrp1Q8C4U3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sfrp1Q8C4U3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sfrp1Q8C4U3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sfrp1Q8C4U3 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sfrp1Q8C4U3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sfrp1Q8C4U3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sfrp1Q8C4U3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sfrp1Q8C4U3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sfrp1Q8C4U3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sfrp1Q8C4U3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sfrp1Q8C4U3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sfrp1Q8C4U3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sfrp1Q8C4U3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sfrp1Q8C4U3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sfrp1Q8C4U3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sfrp1Q8C4U3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sfrp1Q8C4U3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sfrp1Q8C4U3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sfrp1Q8C4U3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sfrp1Q8C4U3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sfrp1Q8C4U3 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sfrp1Q8C4U3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sfrp1Q8C4U3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sfrp1Q8C4U3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Sfrp1Q8C4U3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sfrp1Q8C4U3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sfrp1Q8C4U3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sfrp1Q8C4U3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sfrp1Q8C4U3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sfrp1Q8C4U3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sfrp1Q8C4U3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sfrp1Q8C4U3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sfrp1Q8C4U3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sfrp1Q8C4U3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sfrp1Q8C4U3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sfrp1Q8C4U3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sfrp1Q8C4U3 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sfrp1Q8C4U3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sfrp1Q8C4U3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sfrp1Q8C4U3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sfrp1Q8C4U3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sfrp1Q8C4U3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sfrp1Q8C4U3 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Sfrp1Q8C4U3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sfrp1Q8C4U3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sfrp1Q8C4U3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sfrp1Q8C4U3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sfrp1Q8C4U3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sfrp1Q8C4U3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sfrp1Q8C4U3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Sfrp1Q8C4U3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sfrp1Q8C4U3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sfrp1Q8C4U3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sfrp1Q8C4U3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sfrp1Q8C4U3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sfrp1Q8C4U3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sfrp1Q8C4U3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sfrp1Q8C4U3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sfrp1Q8C4U3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sfrp1Q8C4U3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sfrp1Q8C4U3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sfrp1Q8C4U3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sfrp1Q8C4U3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sfrp1Q8C4U3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sfrp1Q8C4U3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sfrp1Q8C4U3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms