Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q4

Nek11, Serine/threonine-protein kinase Nek11, mousemouse

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Length 628 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek11Q8C0Q4 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nek11Q8C0Q4 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nek11Q8C0Q4 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nek11Q8C0Q4 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nek11Q8C0Q4 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nek11Q8C0Q4 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nek11Q8C0Q4 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nek11Q8C0Q4 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nek11Q8C0Q4 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nek11Q8C0Q4 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Nek11Q8C0Q4 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Nek11Q8C0Q4 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nek11Q8C0Q4 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nek11Q8C0Q4 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nek11Q8C0Q4 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nek11Q8C0Q4 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nek11Q8C0Q4 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nek11Q8C0Q4 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Nek11Q8C0Q4 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Nek11Q8C0Q4 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nek11Q8C0Q4 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nek11Q8C0Q4 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nek11Q8C0Q4 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nek11Q8C0Q4 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nek11Q8C0Q4 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nek11Q8C0Q4 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nek11Q8C0Q4 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nek11Q8C0Q4 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nek11Q8C0Q4 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Nek11Q8C0Q4 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Nek11Q8C0Q4 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Nek11Q8C0Q4 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nek11Q8C0Q4 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nek11Q8C0Q4 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nek11Q8C0Q4 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nek11Q8C0Q4 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nek11Q8C0Q4 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nek11Q8C0Q4 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nek11Q8C0Q4 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nek11Q8C0Q4 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nek11Q8C0Q4 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nek11Q8C0Q4 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Nek11Q8C0Q4 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nek11Q8C0Q4 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nek11Q8C0Q4 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nek11Q8C0Q4 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nek11Q8C0Q4 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nek11Q8C0Q4 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nek11Q8C0Q4 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nek11Q8C0Q4 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nek11Q8C0Q4 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nek11Q8C0Q4 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nek11Q8C0Q4 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nek11Q8C0Q4 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nek11Q8C0Q4 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nek11Q8C0Q4 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nek11Q8C0Q4 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nek11Q8C0Q4 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nek11Q8C0Q4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nek11Q8C0Q4 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nek11Q8C0Q4 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nek11Q8C0Q4 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nek11Q8C0Q4 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nek11Q8C0Q4 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nek11Q8C0Q4 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nek11Q8C0Q4 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nek11Q8C0Q4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nek11Q8C0Q4 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nek11Q8C0Q4 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nek11Q8C0Q4 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nek11Q8C0Q4 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Nek11Q8C0Q4 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nek11Q8C0Q4 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nek11Q8C0Q4 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nek11Q8C0Q4 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nek11Q8C0Q4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nek11Q8C0Q4 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nek11Q8C0Q4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nek11Q8C0Q4 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nek11Q8C0Q4 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nek11Q8C0Q4 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nek11Q8C0Q4 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nek11Q8C0Q4 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nek11Q8C0Q4 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nek11Q8C0Q4 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nek11Q8C0Q4 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nek11Q8C0Q4 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nek11Q8C0Q4 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nek11Q8C0Q4 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nek11Q8C0Q4 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nek11Q8C0Q4 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nek11Q8C0Q4 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nek11Q8C0Q4 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nek11Q8C0Q4 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nek11Q8C0Q4 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Nek11Q8C0Q4 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Nek11Q8C0Q4 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Nek11Q8C0Q4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nek11Q8C0Q4 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nek11Q8C0Q4 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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