Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX32

Slx1b, Structure-specific endonuclease subunit SLX1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx1bQ8BX32 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Slx1bQ8BX32 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slx1bQ8BX32 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Slx1bQ8BX32 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slx1bQ8BX32 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slx1bQ8BX32 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slx1bQ8BX32 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slx1bQ8BX32 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Slx1bQ8BX32 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slx1bQ8BX32 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Slx1bQ8BX32 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slx1bQ8BX32 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slx1bQ8BX32 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slx1bQ8BX32 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slx1bQ8BX32 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slx1bQ8BX32 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Slx1bQ8BX32 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slx1bQ8BX32 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Slx1bQ8BX32 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slx1bQ8BX32 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slx1bQ8BX32 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slx1bQ8BX32 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slx1bQ8BX32 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slx1bQ8BX32 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slx1bQ8BX32 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slx1bQ8BX32 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Slx1bQ8BX32 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slx1bQ8BX32 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slx1bQ8BX32 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slx1bQ8BX32 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slx1bQ8BX32 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slx1bQ8BX32 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slx1bQ8BX32 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slx1bQ8BX32 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slx1bQ8BX32 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slx1bQ8BX32 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slx1bQ8BX32 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slx1bQ8BX32 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slx1bQ8BX32 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slx1bQ8BX32 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slx1bQ8BX32 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slx1bQ8BX32 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slx1bQ8BX32 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slx1bQ8BX32 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slx1bQ8BX32 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slx1bQ8BX32 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slx1bQ8BX32 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Slx1bQ8BX32 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slx1bQ8BX32 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slx1bQ8BX32 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slx1bQ8BX32 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slx1bQ8BX32 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slx1bQ8BX32 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slx1bQ8BX32 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slx1bQ8BX32 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slx1bQ8BX32 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slx1bQ8BX32 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Slx1bQ8BX32 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Slx1bQ8BX32 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Slx1bQ8BX32 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slx1bQ8BX32 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slx1bQ8BX32 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slx1bQ8BX32 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Slx1bQ8BX32 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Slx1bQ8BX32 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slx1bQ8BX32 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slx1bQ8BX32 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slx1bQ8BX32 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slx1bQ8BX32 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slx1bQ8BX32 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slx1bQ8BX32 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Slx1bQ8BX32 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slx1bQ8BX32 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slx1bQ8BX32 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Slx1bQ8BX32 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slx1bQ8BX32 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slx1bQ8BX32 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slx1bQ8BX32 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slx1bQ8BX32 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slx1bQ8BX32 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Slx1bQ8BX32 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slx1bQ8BX32 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slx1bQ8BX32 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slx1bQ8BX32 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slx1bQ8BX32 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slx1bQ8BX32 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slx1bQ8BX32 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slx1bQ8BX32 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slx1bQ8BX32 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slx1bQ8BX32 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slx1bQ8BX32 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slx1bQ8BX32 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Slx1bQ8BX32 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slx1bQ8BX32 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slx1bQ8BX32 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Slx1bQ8BX32 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slx1bQ8BX32 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slx1bQ8BX32 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slx1bQ8BX32 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slx1bQ8BX32 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms