Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWP5

Ttpa, Alpha-tocopherol transfer protein, mousemouse

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtpaQ8BWP5 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TtpaQ8BWP5 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TtpaQ8BWP5 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TtpaQ8BWP5 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TtpaQ8BWP5 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TtpaQ8BWP5 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TtpaQ8BWP5 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TtpaQ8BWP5 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TtpaQ8BWP5 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TtpaQ8BWP5 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TtpaQ8BWP5 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TtpaQ8BWP5 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TtpaQ8BWP5 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TtpaQ8BWP5 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TtpaQ8BWP5 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TtpaQ8BWP5 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TtpaQ8BWP5 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TtpaQ8BWP5 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TtpaQ8BWP5 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TtpaQ8BWP5 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TtpaQ8BWP5 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TtpaQ8BWP5 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TtpaQ8BWP5 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TtpaQ8BWP5 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TtpaQ8BWP5 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TtpaQ8BWP5 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TtpaQ8BWP5 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TtpaQ8BWP5 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TtpaQ8BWP5 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TtpaQ8BWP5 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TtpaQ8BWP5 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TtpaQ8BWP5 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TtpaQ8BWP5 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
TtpaQ8BWP5 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TtpaQ8BWP5 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TtpaQ8BWP5 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TtpaQ8BWP5 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TtpaQ8BWP5 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TtpaQ8BWP5 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TtpaQ8BWP5 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TtpaQ8BWP5 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TtpaQ8BWP5 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TtpaQ8BWP5 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TtpaQ8BWP5 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TtpaQ8BWP5 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TtpaQ8BWP5 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TtpaQ8BWP5 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
TtpaQ8BWP5 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TtpaQ8BWP5 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TtpaQ8BWP5 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TtpaQ8BWP5 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TtpaQ8BWP5 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TtpaQ8BWP5 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TtpaQ8BWP5 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TtpaQ8BWP5 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TtpaQ8BWP5 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TtpaQ8BWP5 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TtpaQ8BWP5 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TtpaQ8BWP5 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TtpaQ8BWP5 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TtpaQ8BWP5 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TtpaQ8BWP5 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TtpaQ8BWP5 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TtpaQ8BWP5 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TtpaQ8BWP5 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TtpaQ8BWP5 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TtpaQ8BWP5 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TtpaQ8BWP5 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TtpaQ8BWP5 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TtpaQ8BWP5 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TtpaQ8BWP5 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TtpaQ8BWP5 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TtpaQ8BWP5 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TtpaQ8BWP5 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TtpaQ8BWP5 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TtpaQ8BWP5 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TtpaQ8BWP5 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TtpaQ8BWP5 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TtpaQ8BWP5 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TtpaQ8BWP5 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TtpaQ8BWP5 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TtpaQ8BWP5 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TtpaQ8BWP5 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TtpaQ8BWP5 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TtpaQ8BWP5 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TtpaQ8BWP5 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TtpaQ8BWP5 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TtpaQ8BWP5 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TtpaQ8BWP5 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TtpaQ8BWP5 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TtpaQ8BWP5 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TtpaQ8BWP5 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TtpaQ8BWP5 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TtpaQ8BWP5 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TtpaQ8BWP5 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TtpaQ8BWP5 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TtpaQ8BWP5 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TtpaQ8BWP5 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TtpaQ8BWP5 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TtpaQ8BWP5 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms