Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSZ2

Ap3s2, AP-3 complex subunit sigma-2, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3s2Q8BSZ2 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap3s2Q8BSZ2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap3s2Q8BSZ2 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap3s2Q8BSZ2 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap3s2Q8BSZ2 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap3s2Q8BSZ2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap3s2Q8BSZ2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap3s2Q8BSZ2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap3s2Q8BSZ2 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap3s2Q8BSZ2 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap3s2Q8BSZ2 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap3s2Q8BSZ2 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap3s2Q8BSZ2 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap3s2Q8BSZ2 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap3s2Q8BSZ2 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap3s2Q8BSZ2 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap3s2Q8BSZ2 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap3s2Q8BSZ2 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ap3s2Q8BSZ2 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap3s2Q8BSZ2 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap3s2Q8BSZ2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap3s2Q8BSZ2 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap3s2Q8BSZ2 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap3s2Q8BSZ2 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap3s2Q8BSZ2 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap3s2Q8BSZ2 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap3s2Q8BSZ2 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap3s2Q8BSZ2 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap3s2Q8BSZ2 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap3s2Q8BSZ2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap3s2Q8BSZ2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap3s2Q8BSZ2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap3s2Q8BSZ2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap3s2Q8BSZ2 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap3s2Q8BSZ2 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap3s2Q8BSZ2 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap3s2Q8BSZ2 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap3s2Q8BSZ2 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap3s2Q8BSZ2 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap3s2Q8BSZ2 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap3s2Q8BSZ2 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ap3s2Q8BSZ2 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ap3s2Q8BSZ2 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ap3s2Q8BSZ2 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ap3s2Q8BSZ2 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ap3s2Q8BSZ2 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ap3s2Q8BSZ2 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ap3s2Q8BSZ2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ap3s2Q8BSZ2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ap3s2Q8BSZ2 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ap3s2Q8BSZ2 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ap3s2Q8BSZ2 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ap3s2Q8BSZ2 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ap3s2Q8BSZ2 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ap3s2Q8BSZ2 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ap3s2Q8BSZ2 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap3s2Q8BSZ2 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap3s2Q8BSZ2 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap3s2Q8BSZ2 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap3s2Q8BSZ2 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap3s2Q8BSZ2 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap3s2Q8BSZ2 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap3s2Q8BSZ2 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap3s2Q8BSZ2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap3s2Q8BSZ2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap3s2Q8BSZ2 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap3s2Q8BSZ2 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap3s2Q8BSZ2 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap3s2Q8BSZ2 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap3s2Q8BSZ2 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap3s2Q8BSZ2 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap3s2Q8BSZ2 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap3s2Q8BSZ2 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap3s2Q8BSZ2 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ap3s2Q8BSZ2 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap3s2Q8BSZ2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap3s2Q8BSZ2 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap3s2Q8BSZ2 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap3s2Q8BSZ2 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap3s2Q8BSZ2 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap3s2Q8BSZ2 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap3s2Q8BSZ2 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap3s2Q8BSZ2 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap3s2Q8BSZ2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap3s2Q8BSZ2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap3s2Q8BSZ2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap3s2Q8BSZ2 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap3s2Q8BSZ2 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap3s2Q8BSZ2 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap3s2Q8BSZ2 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap3s2Q8BSZ2 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap3s2Q8BSZ2 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap3s2Q8BSZ2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap3s2Q8BSZ2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ap3s2Q8BSZ2 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ap3s2Q8BSZ2 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ap3s2Q8BSZ2 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ap3s2Q8BSZ2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ap3s2Q8BSZ2 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ap3s2Q8BSZ2 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms