Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSQ9

Pbrm1, Protein polybromo-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbrm1Q8BSQ9 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Pbrm1Q8BSQ9 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Pbrm1Q8BSQ9 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Pbrm1Q8BSQ9 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Pbrm1Q8BSQ9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Pbrm1Q8BSQ9 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Pbrm1Q8BSQ9 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Pbrm1Q8BSQ9 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Pbrm1Q8BSQ9 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Pbrm1Q8BSQ9 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Pbrm1Q8BSQ9 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Pbrm1Q8BSQ9 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Pbrm1Q8BSQ9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Pbrm1Q8BSQ9 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Pbrm1Q8BSQ9 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Pbrm1Q8BSQ9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Pbrm1Q8BSQ9 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Pbrm1Q8BSQ9 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Pbrm1Q8BSQ9 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Pbrm1Q8BSQ9 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Pbrm1Q8BSQ9 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Pbrm1Q8BSQ9 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Pbrm1Q8BSQ9 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Pbrm1Q8BSQ9 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
Pbrm1Q8BSQ9 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Pbrm1Q8BSQ9 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Pbrm1Q8BSQ9 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Pbrm1Q8BSQ9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Pbrm1Q8BSQ9 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Pbrm1Q8BSQ9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Pbrm1Q8BSQ9 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Pbrm1Q8BSQ9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Pbrm1Q8BSQ9 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Pbrm1Q8BSQ9 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Pbrm1Q8BSQ9 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Pbrm1Q8BSQ9 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Pbrm1Q8BSQ9 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Pbrm1Q8BSQ9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Pbrm1Q8BSQ9 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Pbrm1Q8BSQ9 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Pbrm1Q8BSQ9 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Pbrm1Q8BSQ9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Pbrm1Q8BSQ9 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Pbrm1Q8BSQ9 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Pbrm1Q8BSQ9 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Pbrm1Q8BSQ9 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Pbrm1Q8BSQ9 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Pbrm1Q8BSQ9 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Pbrm1Q8BSQ9 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Pbrm1Q8BSQ9 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Pbrm1Q8BSQ9 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Pbrm1Q8BSQ9 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Pbrm1Q8BSQ9 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Pbrm1Q8BSQ9 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Pbrm1Q8BSQ9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Pbrm1Q8BSQ9 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Pbrm1Q8BSQ9 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Pbrm1Q8BSQ9 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Pbrm1Q8BSQ9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Pbrm1Q8BSQ9 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Pbrm1Q8BSQ9 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Pbrm1Q8BSQ9 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Pbrm1Q8BSQ9 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Pbrm1Q8BSQ9 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Pbrm1Q8BSQ9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Pbrm1Q8BSQ9 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Pbrm1Q8BSQ9 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Pbrm1Q8BSQ9 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Pbrm1Q8BSQ9 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Pbrm1Q8BSQ9 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Pbrm1Q8BSQ9 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Pbrm1Q8BSQ9 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Pbrm1Q8BSQ9 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Pbrm1Q8BSQ9 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Pbrm1Q8BSQ9 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Pbrm1Q8BSQ9 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Pbrm1Q8BSQ9 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Pbrm1Q8BSQ9 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Pbrm1Q8BSQ9 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Pbrm1Q8BSQ9 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Pbrm1Q8BSQ9 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Pbrm1Q8BSQ9 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Pbrm1Q8BSQ9 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Pbrm1Q8BSQ9 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
Pbrm1Q8BSQ9 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Pbrm1Q8BSQ9 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Pbrm1Q8BSQ9 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Pbrm1Q8BSQ9 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Pbrm1Q8BSQ9 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Pbrm1Q8BSQ9 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Pbrm1Q8BSQ9 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Pbrm1Q8BSQ9 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Pbrm1Q8BSQ9 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Pbrm1Q8BSQ9 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Pbrm1Q8BSQ9 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Pbrm1Q8BSQ9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Pbrm1Q8BSQ9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Pbrm1Q8BSQ9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Pbrm1Q8BSQ9 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Pbrm1Q8BSQ9 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms