Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSD5

She, SH2 domain-containing adapter protein E, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SheQ8BSD5 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SheQ8BSD5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SheQ8BSD5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SheQ8BSD5 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SheQ8BSD5 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SheQ8BSD5 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SheQ8BSD5 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SheQ8BSD5 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SheQ8BSD5 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SheQ8BSD5 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SheQ8BSD5 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SheQ8BSD5 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SheQ8BSD5 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SheQ8BSD5 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SheQ8BSD5 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SheQ8BSD5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SheQ8BSD5 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SheQ8BSD5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SheQ8BSD5 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SheQ8BSD5 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SheQ8BSD5 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SheQ8BSD5 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SheQ8BSD5 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SheQ8BSD5 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SheQ8BSD5 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SheQ8BSD5 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SheQ8BSD5 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SheQ8BSD5 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SheQ8BSD5 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SheQ8BSD5 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SheQ8BSD5 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SheQ8BSD5 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SheQ8BSD5 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SheQ8BSD5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SheQ8BSD5 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SheQ8BSD5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SheQ8BSD5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SheQ8BSD5 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SheQ8BSD5 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SheQ8BSD5 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SheQ8BSD5 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SheQ8BSD5 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SheQ8BSD5 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SheQ8BSD5 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SheQ8BSD5 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SheQ8BSD5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SheQ8BSD5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SheQ8BSD5 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SheQ8BSD5 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SheQ8BSD5 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SheQ8BSD5 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SheQ8BSD5 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SheQ8BSD5 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SheQ8BSD5 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SheQ8BSD5 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SheQ8BSD5 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SheQ8BSD5 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SheQ8BSD5 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SheQ8BSD5 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SheQ8BSD5 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SheQ8BSD5 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SheQ8BSD5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SheQ8BSD5 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SheQ8BSD5 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SheQ8BSD5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SheQ8BSD5 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SheQ8BSD5 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SheQ8BSD5 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SheQ8BSD5 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SheQ8BSD5 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SheQ8BSD5 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SheQ8BSD5 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SheQ8BSD5 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SheQ8BSD5 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SheQ8BSD5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SheQ8BSD5 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SheQ8BSD5 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SheQ8BSD5 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SheQ8BSD5 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SheQ8BSD5 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SheQ8BSD5 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SheQ8BSD5 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SheQ8BSD5 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SheQ8BSD5 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SheQ8BSD5 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SheQ8BSD5 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SheQ8BSD5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SheQ8BSD5 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SheQ8BSD5 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SheQ8BSD5 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SheQ8BSD5 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SheQ8BSD5 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SheQ8BSD5 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SheQ8BSD5 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SheQ8BSD5 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SheQ8BSD5 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SheQ8BSD5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SheQ8BSD5 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SheQ8BSD5 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SheQ8BSD5 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms