Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKW4

Zcchc4, Zinc finger CCHC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc4Q8BKW4 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zcchc4Q8BKW4 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zcchc4Q8BKW4 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zcchc4Q8BKW4 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zcchc4Q8BKW4 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zcchc4Q8BKW4 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zcchc4Q8BKW4 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zcchc4Q8BKW4 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zcchc4Q8BKW4 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zcchc4Q8BKW4 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zcchc4Q8BKW4 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zcchc4Q8BKW4 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zcchc4Q8BKW4 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zcchc4Q8BKW4 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Zcchc4Q8BKW4 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Zcchc4Q8BKW4 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Zcchc4Q8BKW4 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zcchc4Q8BKW4 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zcchc4Q8BKW4 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zcchc4Q8BKW4 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zcchc4Q8BKW4 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zcchc4Q8BKW4 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zcchc4Q8BKW4 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zcchc4Q8BKW4 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zcchc4Q8BKW4 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zcchc4Q8BKW4 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zcchc4Q8BKW4 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zcchc4Q8BKW4 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zcchc4Q8BKW4 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zcchc4Q8BKW4 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zcchc4Q8BKW4 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zcchc4Q8BKW4 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zcchc4Q8BKW4 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Zcchc4Q8BKW4 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zcchc4Q8BKW4 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Zcchc4Q8BKW4 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zcchc4Q8BKW4 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zcchc4Q8BKW4 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zcchc4Q8BKW4 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zcchc4Q8BKW4 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zcchc4Q8BKW4 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zcchc4Q8BKW4 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zcchc4Q8BKW4 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zcchc4Q8BKW4 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zcchc4Q8BKW4 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zcchc4Q8BKW4 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zcchc4Q8BKW4 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zcchc4Q8BKW4 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zcchc4Q8BKW4 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zcchc4Q8BKW4 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zcchc4Q8BKW4 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zcchc4Q8BKW4 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zcchc4Q8BKW4 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zcchc4Q8BKW4 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zcchc4Q8BKW4 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zcchc4Q8BKW4 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zcchc4Q8BKW4 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zcchc4Q8BKW4 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zcchc4Q8BKW4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zcchc4Q8BKW4 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zcchc4Q8BKW4 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Zcchc4Q8BKW4 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zcchc4Q8BKW4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zcchc4Q8BKW4 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zcchc4Q8BKW4 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zcchc4Q8BKW4 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Zcchc4Q8BKW4 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zcchc4Q8BKW4 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zcchc4Q8BKW4 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zcchc4Q8BKW4 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zcchc4Q8BKW4 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zcchc4Q8BKW4 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zcchc4Q8BKW4 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zcchc4Q8BKW4 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zcchc4Q8BKW4 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zcchc4Q8BKW4 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zcchc4Q8BKW4 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zcchc4Q8BKW4 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zcchc4Q8BKW4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zcchc4Q8BKW4 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zcchc4Q8BKW4 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zcchc4Q8BKW4 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zcchc4Q8BKW4 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zcchc4Q8BKW4 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zcchc4Q8BKW4 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zcchc4Q8BKW4 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zcchc4Q8BKW4 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zcchc4Q8BKW4 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zcchc4Q8BKW4 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zcchc4Q8BKW4 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zcchc4Q8BKW4 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zcchc4Q8BKW4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Zcchc4Q8BKW4 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zcchc4Q8BKW4 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zcchc4Q8BKW4 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zcchc4Q8BKW4 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zcchc4Q8BKW4 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zcchc4Q8BKW4 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zcchc4Q8BKW4 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zcchc4Q8BKW4 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms