Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGF0

AW551984, Expressed sequence AW551984, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AW551984Q8BGF0 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AW551984Q8BGF0 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AW551984Q8BGF0 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AW551984Q8BGF0 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
AW551984Q8BGF0 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
AW551984Q8BGF0 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AW551984Q8BGF0 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
AW551984Q8BGF0 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AW551984Q8BGF0 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AW551984Q8BGF0 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AW551984Q8BGF0 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AW551984Q8BGF0 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AW551984Q8BGF0 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AW551984Q8BGF0 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
AW551984Q8BGF0 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AW551984Q8BGF0 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
AW551984Q8BGF0 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
AW551984Q8BGF0 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AW551984Q8BGF0 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
AW551984Q8BGF0 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AW551984Q8BGF0 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AW551984Q8BGF0 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
AW551984Q8BGF0 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AW551984Q8BGF0 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AW551984Q8BGF0 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AW551984Q8BGF0 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AW551984Q8BGF0 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AW551984Q8BGF0 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AW551984Q8BGF0 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AW551984Q8BGF0 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AW551984Q8BGF0 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AW551984Q8BGF0 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AW551984Q8BGF0 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
AW551984Q8BGF0 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AW551984Q8BGF0 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AW551984Q8BGF0 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AW551984Q8BGF0 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AW551984Q8BGF0 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AW551984Q8BGF0 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AW551984Q8BGF0 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AW551984Q8BGF0 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AW551984Q8BGF0 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AW551984Q8BGF0 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
AW551984Q8BGF0 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AW551984Q8BGF0 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
AW551984Q8BGF0 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AW551984Q8BGF0 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AW551984Q8BGF0 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AW551984Q8BGF0 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AW551984Q8BGF0 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AW551984Q8BGF0 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AW551984Q8BGF0 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AW551984Q8BGF0 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AW551984Q8BGF0 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AW551984Q8BGF0 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AW551984Q8BGF0 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AW551984Q8BGF0 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AW551984Q8BGF0 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AW551984Q8BGF0 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AW551984Q8BGF0 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AW551984Q8BGF0 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AW551984Q8BGF0 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AW551984Q8BGF0 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AW551984Q8BGF0 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AW551984Q8BGF0 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AW551984Q8BGF0 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AW551984Q8BGF0 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AW551984Q8BGF0 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AW551984Q8BGF0 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AW551984Q8BGF0 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
AW551984Q8BGF0 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AW551984Q8BGF0 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AW551984Q8BGF0 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AW551984Q8BGF0 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AW551984Q8BGF0 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AW551984Q8BGF0 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AW551984Q8BGF0 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
AW551984Q8BGF0 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AW551984Q8BGF0 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AW551984Q8BGF0 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AW551984Q8BGF0 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AW551984Q8BGF0 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
AW551984Q8BGF0 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
AW551984Q8BGF0 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
AW551984Q8BGF0 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
AW551984Q8BGF0 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
AW551984Q8BGF0 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AW551984Q8BGF0 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AW551984Q8BGF0 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AW551984Q8BGF0 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AW551984Q8BGF0 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AW551984Q8BGF0 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AW551984Q8BGF0 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AW551984Q8BGF0 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AW551984Q8BGF0 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AW551984Q8BGF0 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AW551984Q8BGF0 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
AW551984Q8BGF0 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AW551984Q8BGF0 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AW551984Q8BGF0 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms