Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG40

Katnb1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Katnb1Q8BG40 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Katnb1Q8BG40 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Katnb1Q8BG40 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Katnb1Q8BG40 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Katnb1Q8BG40 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Katnb1Q8BG40 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Katnb1Q8BG40 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Katnb1Q8BG40 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Katnb1Q8BG40 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Katnb1Q8BG40 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Katnb1Q8BG40 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Katnb1Q8BG40 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Katnb1Q8BG40 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Katnb1Q8BG40 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Katnb1Q8BG40 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Katnb1Q8BG40 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Katnb1Q8BG40 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Katnb1Q8BG40 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Katnb1Q8BG40 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Katnb1Q8BG40 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Katnb1Q8BG40 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Katnb1Q8BG40 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Katnb1Q8BG40 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Katnb1Q8BG40 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Katnb1Q8BG40 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Katnb1Q8BG40 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Katnb1Q8BG40 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Katnb1Q8BG40 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Katnb1Q8BG40 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Katnb1Q8BG40 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Katnb1Q8BG40 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Katnb1Q8BG40 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Katnb1Q8BG40 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Katnb1Q8BG40 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Katnb1Q8BG40 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Katnb1Q8BG40 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Katnb1Q8BG40 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Katnb1Q8BG40 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Katnb1Q8BG40 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Katnb1Q8BG40 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Katnb1Q8BG40 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Katnb1Q8BG40 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Katnb1Q8BG40 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Katnb1Q8BG40 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Katnb1Q8BG40 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Katnb1Q8BG40 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Katnb1Q8BG40 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Katnb1Q8BG40 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Katnb1Q8BG40 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Katnb1Q8BG40 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Katnb1Q8BG40 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Katnb1Q8BG40 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Katnb1Q8BG40 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Katnb1Q8BG40 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Katnb1Q8BG40 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Katnb1Q8BG40 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Katnb1Q8BG40 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Katnb1Q8BG40 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Katnb1Q8BG40 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Katnb1Q8BG40 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Katnb1Q8BG40 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Katnb1Q8BG40 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Katnb1Q8BG40 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Katnb1Q8BG40 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Katnb1Q8BG40 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Katnb1Q8BG40 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Katnb1Q8BG40 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Katnb1Q8BG40 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Katnb1Q8BG40 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Katnb1Q8BG40 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Katnb1Q8BG40 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Katnb1Q8BG40 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Katnb1Q8BG40 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Katnb1Q8BG40 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Katnb1Q8BG40 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Katnb1Q8BG40 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Katnb1Q8BG40 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Katnb1Q8BG40 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Katnb1Q8BG40 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Katnb1Q8BG40 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Katnb1Q8BG40 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Katnb1Q8BG40 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Katnb1Q8BG40 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Katnb1Q8BG40 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Katnb1Q8BG40 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Katnb1Q8BG40 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Katnb1Q8BG40 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Katnb1Q8BG40 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Katnb1Q8BG40 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Katnb1Q8BG40 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Katnb1Q8BG40 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Katnb1Q8BG40 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Katnb1Q8BG40 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Katnb1Q8BG40 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Katnb1Q8BG40 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Katnb1Q8BG40 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Katnb1Q8BG40 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Katnb1Q8BG40 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Katnb1Q8BG40 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Katnb1Q8BG40 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms