Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG39

Sv2b, Synaptic vesicle glycoprotein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2bQ8BG39 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sv2bQ8BG39 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sv2bQ8BG39 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sv2bQ8BG39 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sv2bQ8BG39 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sv2bQ8BG39 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sv2bQ8BG39 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Sv2bQ8BG39 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sv2bQ8BG39 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sv2bQ8BG39 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sv2bQ8BG39 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sv2bQ8BG39 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sv2bQ8BG39 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sv2bQ8BG39 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sv2bQ8BG39 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sv2bQ8BG39 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sv2bQ8BG39 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sv2bQ8BG39 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Sv2bQ8BG39 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sv2bQ8BG39 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sv2bQ8BG39 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sv2bQ8BG39 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sv2bQ8BG39 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sv2bQ8BG39 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sv2bQ8BG39 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sv2bQ8BG39 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sv2bQ8BG39 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sv2bQ8BG39 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sv2bQ8BG39 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sv2bQ8BG39 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sv2bQ8BG39 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sv2bQ8BG39 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sv2bQ8BG39 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sv2bQ8BG39 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Sv2bQ8BG39 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sv2bQ8BG39 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sv2bQ8BG39 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sv2bQ8BG39 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sv2bQ8BG39 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sv2bQ8BG39 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sv2bQ8BG39 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sv2bQ8BG39 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sv2bQ8BG39 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sv2bQ8BG39 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sv2bQ8BG39 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Sv2bQ8BG39 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Sv2bQ8BG39 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sv2bQ8BG39 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sv2bQ8BG39 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sv2bQ8BG39 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sv2bQ8BG39 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sv2bQ8BG39 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sv2bQ8BG39 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sv2bQ8BG39 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sv2bQ8BG39 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sv2bQ8BG39 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sv2bQ8BG39 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sv2bQ8BG39 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sv2bQ8BG39 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sv2bQ8BG39 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sv2bQ8BG39 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sv2bQ8BG39 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sv2bQ8BG39 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sv2bQ8BG39 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sv2bQ8BG39 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sv2bQ8BG39 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sv2bQ8BG39 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Sv2bQ8BG39 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sv2bQ8BG39 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sv2bQ8BG39 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sv2bQ8BG39 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sv2bQ8BG39 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sv2bQ8BG39 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sv2bQ8BG39 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sv2bQ8BG39 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sv2bQ8BG39 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sv2bQ8BG39 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sv2bQ8BG39 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sv2bQ8BG39 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sv2bQ8BG39 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Sv2bQ8BG39 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sv2bQ8BG39 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sv2bQ8BG39 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sv2bQ8BG39 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sv2bQ8BG39 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sv2bQ8BG39 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sv2bQ8BG39 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sv2bQ8BG39 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sv2bQ8BG39 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sv2bQ8BG39 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sv2bQ8BG39 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sv2bQ8BG39 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sv2bQ8BG39 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Sv2bQ8BG39 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sv2bQ8BG39 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sv2bQ8BG39 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sv2bQ8BG39 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sv2bQ8BG39 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sv2bQ8BG39 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sv2bQ8BG39 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms