Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG17

Nol12, Nucleolar protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nol12Q8BG17 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nol12Q8BG17 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nol12Q8BG17 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Nol12Q8BG17 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Nol12Q8BG17 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nol12Q8BG17 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Nol12Q8BG17 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nol12Q8BG17 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Nol12Q8BG17 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nol12Q8BG17 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Nol12Q8BG17 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nol12Q8BG17 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Nol12Q8BG17 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Nol12Q8BG17 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nol12Q8BG17 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nol12Q8BG17 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nol12Q8BG17 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nol12Q8BG17 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nol12Q8BG17 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nol12Q8BG17 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nol12Q8BG17 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nol12Q8BG17 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nol12Q8BG17 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nol12Q8BG17 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nol12Q8BG17 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nol12Q8BG17 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nol12Q8BG17 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Nol12Q8BG17 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Nol12Q8BG17 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nol12Q8BG17 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nol12Q8BG17 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nol12Q8BG17 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nol12Q8BG17 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nol12Q8BG17 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nol12Q8BG17 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nol12Q8BG17 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nol12Q8BG17 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nol12Q8BG17 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nol12Q8BG17 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nol12Q8BG17 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nol12Q8BG17 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nol12Q8BG17 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nol12Q8BG17 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.28■■□□□ 1
Nol12Q8BG17 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Nol12Q8BG17 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nol12Q8BG17 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nol12Q8BG17 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nol12Q8BG17 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nol12Q8BG17 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Nol12Q8BG17 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nol12Q8BG17 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nol12Q8BG17 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nol12Q8BG17 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Nol12Q8BG17 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nol12Q8BG17 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Nol12Q8BG17 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nol12Q8BG17 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Nol12Q8BG17 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nol12Q8BG17 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Nol12Q8BG17 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Nol12Q8BG17 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Nol12Q8BG17 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Nol12Q8BG17 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nol12Q8BG17 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nol12Q8BG17 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nol12Q8BG17 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nol12Q8BG17 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nol12Q8BG17 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nol12Q8BG17 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nol12Q8BG17 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nol12Q8BG17 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nol12Q8BG17 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nol12Q8BG17 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nol12Q8BG17 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nol12Q8BG17 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nol12Q8BG17 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nol12Q8BG17 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nol12Q8BG17 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nol12Q8BG17 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nol12Q8BG17 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nol12Q8BG17 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nol12Q8BG17 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nol12Q8BG17 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nol12Q8BG17 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nol12Q8BG17 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nol12Q8BG17 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nol12Q8BG17 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nol12Q8BG17 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nol12Q8BG17 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nol12Q8BG17 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nol12Q8BG17 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nol12Q8BG17 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nol12Q8BG17 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Nol12Q8BG17 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nol12Q8BG17 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nol12Q8BG17 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nol12Q8BG17 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nol12Q8BG17 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nol12Q8BG17 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nol12Q8BG17 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms