Protein–RNA interactions for Protein: Q812A2

Srgap3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srgap3Q812A2 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Srgap3Q812A2 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Srgap3Q812A2 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Srgap3Q812A2 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Srgap3Q812A2 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Srgap3Q812A2 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Srgap3Q812A2 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Srgap3Q812A2 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Srgap3Q812A2 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Srgap3Q812A2 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Srgap3Q812A2 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Srgap3Q812A2 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Srgap3Q812A2 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Srgap3Q812A2 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Srgap3Q812A2 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Srgap3Q812A2 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Srgap3Q812A2 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Srgap3Q812A2 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Srgap3Q812A2 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Srgap3Q812A2 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Srgap3Q812A2 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Srgap3Q812A2 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Srgap3Q812A2 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Srgap3Q812A2 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Srgap3Q812A2 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Srgap3Q812A2 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Srgap3Q812A2 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Srgap3Q812A2 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Srgap3Q812A2 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Srgap3Q812A2 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Srgap3Q812A2 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Srgap3Q812A2 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Srgap3Q812A2 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Srgap3Q812A2 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Srgap3Q812A2 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Srgap3Q812A2 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Srgap3Q812A2 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Srgap3Q812A2 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Srgap3Q812A2 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Srgap3Q812A2 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Srgap3Q812A2 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Srgap3Q812A2 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Srgap3Q812A2 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Srgap3Q812A2 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Srgap3Q812A2 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Srgap3Q812A2 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Srgap3Q812A2 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Srgap3Q812A2 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Srgap3Q812A2 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Srgap3Q812A2 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Srgap3Q812A2 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Srgap3Q812A2 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Srgap3Q812A2 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Srgap3Q812A2 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Srgap3Q812A2 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Srgap3Q812A2 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Srgap3Q812A2 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Srgap3Q812A2 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Srgap3Q812A2 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Srgap3Q812A2 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Srgap3Q812A2 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Srgap3Q812A2 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Srgap3Q812A2 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Srgap3Q812A2 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Srgap3Q812A2 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Srgap3Q812A2 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Srgap3Q812A2 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Srgap3Q812A2 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Srgap3Q812A2 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Srgap3Q812A2 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Srgap3Q812A2 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Srgap3Q812A2 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Srgap3Q812A2 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Srgap3Q812A2 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Srgap3Q812A2 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Srgap3Q812A2 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Srgap3Q812A2 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Srgap3Q812A2 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Srgap3Q812A2 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Srgap3Q812A2 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Srgap3Q812A2 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Srgap3Q812A2 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Srgap3Q812A2 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Srgap3Q812A2 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Srgap3Q812A2 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Srgap3Q812A2 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Srgap3Q812A2 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Srgap3Q812A2 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Srgap3Q812A2 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Srgap3Q812A2 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Srgap3Q812A2 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Srgap3Q812A2 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Srgap3Q812A2 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Srgap3Q812A2 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Srgap3Q812A2 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Srgap3Q812A2 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Srgap3Q812A2 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Srgap3Q812A2 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Srgap3Q812A2 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Srgap3Q812A2 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms