Protein–RNA interactions for Protein: Q811C2

Atg4c, Cysteine protease ATG4C, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4cQ811C2 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atg4cQ811C2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atg4cQ811C2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atg4cQ811C2 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Atg4cQ811C2 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atg4cQ811C2 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atg4cQ811C2 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atg4cQ811C2 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atg4cQ811C2 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atg4cQ811C2 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atg4cQ811C2 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atg4cQ811C2 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atg4cQ811C2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atg4cQ811C2 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Atg4cQ811C2 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atg4cQ811C2 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atg4cQ811C2 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Atg4cQ811C2 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Atg4cQ811C2 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atg4cQ811C2 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atg4cQ811C2 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atg4cQ811C2 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atg4cQ811C2 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atg4cQ811C2 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atg4cQ811C2 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atg4cQ811C2 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atg4cQ811C2 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Atg4cQ811C2 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atg4cQ811C2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atg4cQ811C2 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg4cQ811C2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg4cQ811C2 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg4cQ811C2 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg4cQ811C2 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg4cQ811C2 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg4cQ811C2 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg4cQ811C2 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg4cQ811C2 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg4cQ811C2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg4cQ811C2 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg4cQ811C2 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg4cQ811C2 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg4cQ811C2 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg4cQ811C2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg4cQ811C2 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg4cQ811C2 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg4cQ811C2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg4cQ811C2 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg4cQ811C2 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atg4cQ811C2 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg4cQ811C2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg4cQ811C2 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg4cQ811C2 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg4cQ811C2 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg4cQ811C2 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg4cQ811C2 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg4cQ811C2 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg4cQ811C2 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg4cQ811C2 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg4cQ811C2 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg4cQ811C2 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg4cQ811C2 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg4cQ811C2 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg4cQ811C2 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg4cQ811C2 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg4cQ811C2 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg4cQ811C2 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg4cQ811C2 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg4cQ811C2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atg4cQ811C2 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atg4cQ811C2 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atg4cQ811C2 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atg4cQ811C2 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atg4cQ811C2 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atg4cQ811C2 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atg4cQ811C2 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atg4cQ811C2 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atg4cQ811C2 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atg4cQ811C2 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atg4cQ811C2 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atg4cQ811C2 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atg4cQ811C2 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atg4cQ811C2 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atg4cQ811C2 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atg4cQ811C2 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atg4cQ811C2 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atg4cQ811C2 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atg4cQ811C2 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atg4cQ811C2 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atg4cQ811C2 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atg4cQ811C2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atg4cQ811C2 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atg4cQ811C2 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atg4cQ811C2 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atg4cQ811C2 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Atg4cQ811C2 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atg4cQ811C2 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atg4cQ811C2 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atg4cQ811C2 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atg4cQ811C2 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms