Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ChfrQ810L3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ChfrQ810L3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ChfrQ810L3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ChfrQ810L3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ChfrQ810L3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ChfrQ810L3 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ChfrQ810L3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ChfrQ810L3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ChfrQ810L3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ChfrQ810L3 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ChfrQ810L3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ChfrQ810L3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ChfrQ810L3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ChfrQ810L3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ChfrQ810L3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ChfrQ810L3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ChfrQ810L3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ChfrQ810L3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ChfrQ810L3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ChfrQ810L3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ChfrQ810L3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ChfrQ810L3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ChfrQ810L3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ChfrQ810L3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ChfrQ810L3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ChfrQ810L3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ChfrQ810L3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ChfrQ810L3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ChfrQ810L3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ChfrQ810L3 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ChfrQ810L3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ChfrQ810L3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ChfrQ810L3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ChfrQ810L3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ChfrQ810L3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ChfrQ810L3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ChfrQ810L3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ChfrQ810L3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ChfrQ810L3 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ChfrQ810L3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ChfrQ810L3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ChfrQ810L3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ChfrQ810L3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ChfrQ810L3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ChfrQ810L3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ChfrQ810L3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ChfrQ810L3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ChfrQ810L3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ChfrQ810L3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ChfrQ810L3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ChfrQ810L3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ChfrQ810L3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ChfrQ810L3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ChfrQ810L3 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ChfrQ810L3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ChfrQ810L3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ChfrQ810L3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ChfrQ810L3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ChfrQ810L3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ChfrQ810L3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ChfrQ810L3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ChfrQ810L3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ChfrQ810L3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ChfrQ810L3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ChfrQ810L3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ChfrQ810L3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ChfrQ810L3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ChfrQ810L3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ChfrQ810L3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ChfrQ810L3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ChfrQ810L3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ChfrQ810L3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ChfrQ810L3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ChfrQ810L3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ChfrQ810L3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ChfrQ810L3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ChfrQ810L3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ChfrQ810L3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ChfrQ810L3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ChfrQ810L3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ChfrQ810L3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ChfrQ810L3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ChfrQ810L3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ChfrQ810L3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ChfrQ810L3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ChfrQ810L3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ChfrQ810L3 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ChfrQ810L3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ChfrQ810L3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ChfrQ810L3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ChfrQ810L3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ChfrQ810L3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ChfrQ810L3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ChfrQ810L3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ChfrQ810L3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ChfrQ810L3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ChfrQ810L3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ChfrQ810L3 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ChfrQ810L3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms