Protein–RNA interactions for Protein: Q80XU8

Lrfn4, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrfn4Q80XU8 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrfn4Q80XU8 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrfn4Q80XU8 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrfn4Q80XU8 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrfn4Q80XU8 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrfn4Q80XU8 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrfn4Q80XU8 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrfn4Q80XU8 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrfn4Q80XU8 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrfn4Q80XU8 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrfn4Q80XU8 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrfn4Q80XU8 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrfn4Q80XU8 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrfn4Q80XU8 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrfn4Q80XU8 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrfn4Q80XU8 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrfn4Q80XU8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrfn4Q80XU8 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrfn4Q80XU8 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrfn4Q80XU8 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrfn4Q80XU8 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrfn4Q80XU8 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrfn4Q80XU8 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrfn4Q80XU8 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrfn4Q80XU8 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrfn4Q80XU8 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrfn4Q80XU8 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrfn4Q80XU8 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrfn4Q80XU8 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrfn4Q80XU8 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrfn4Q80XU8 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrfn4Q80XU8 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrfn4Q80XU8 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrfn4Q80XU8 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrfn4Q80XU8 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrfn4Q80XU8 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrfn4Q80XU8 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrfn4Q80XU8 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrfn4Q80XU8 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrfn4Q80XU8 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrfn4Q80XU8 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrfn4Q80XU8 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrfn4Q80XU8 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrfn4Q80XU8 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrfn4Q80XU8 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrfn4Q80XU8 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrfn4Q80XU8 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrfn4Q80XU8 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrfn4Q80XU8 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrfn4Q80XU8 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrfn4Q80XU8 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrfn4Q80XU8 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrfn4Q80XU8 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrfn4Q80XU8 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrfn4Q80XU8 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrfn4Q80XU8 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrfn4Q80XU8 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrfn4Q80XU8 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrfn4Q80XU8 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrfn4Q80XU8 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrfn4Q80XU8 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrfn4Q80XU8 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrfn4Q80XU8 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrfn4Q80XU8 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrfn4Q80XU8 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrfn4Q80XU8 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrfn4Q80XU8 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrfn4Q80XU8 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrfn4Q80XU8 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrfn4Q80XU8 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrfn4Q80XU8 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrfn4Q80XU8 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrfn4Q80XU8 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrfn4Q80XU8 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrfn4Q80XU8 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrfn4Q80XU8 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrfn4Q80XU8 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrfn4Q80XU8 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrfn4Q80XU8 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrfn4Q80XU8 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrfn4Q80XU8 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrfn4Q80XU8 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrfn4Q80XU8 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrfn4Q80XU8 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrfn4Q80XU8 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrfn4Q80XU8 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrfn4Q80XU8 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrfn4Q80XU8 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrfn4Q80XU8 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrfn4Q80XU8 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrfn4Q80XU8 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrfn4Q80XU8 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrfn4Q80XU8 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrfn4Q80XU8 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrfn4Q80XU8 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrfn4Q80XU8 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrfn4Q80XU8 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrfn4Q80XU8 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrfn4Q80XU8 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrfn4Q80XU8 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms