Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc28Q80XJ3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc28Q80XJ3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc28Q80XJ3 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc28Q80XJ3 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc28Q80XJ3 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc28Q80XJ3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc28Q80XJ3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc28Q80XJ3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc28Q80XJ3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc28Q80XJ3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ttc28Q80XJ3 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ttc28Q80XJ3 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Ttc28Q80XJ3 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ttc28Q80XJ3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ttc28Q80XJ3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ttc28Q80XJ3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ttc28Q80XJ3 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ttc28Q80XJ3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ttc28Q80XJ3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ttc28Q80XJ3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc28Q80XJ3 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc28Q80XJ3 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc28Q80XJ3 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc28Q80XJ3 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc28Q80XJ3 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc28Q80XJ3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc28Q80XJ3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc28Q80XJ3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc28Q80XJ3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc28Q80XJ3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc28Q80XJ3 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc28Q80XJ3 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc28Q80XJ3 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc28Q80XJ3 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc28Q80XJ3 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc28Q80XJ3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ttc28Q80XJ3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc28Q80XJ3 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc28Q80XJ3 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc28Q80XJ3 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc28Q80XJ3 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc28Q80XJ3 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc28Q80XJ3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc28Q80XJ3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc28Q80XJ3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc28Q80XJ3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc28Q80XJ3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc28Q80XJ3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc28Q80XJ3 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc28Q80XJ3 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc28Q80XJ3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc28Q80XJ3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ttc28Q80XJ3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc28Q80XJ3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc28Q80XJ3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc28Q80XJ3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc28Q80XJ3 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc28Q80XJ3 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc28Q80XJ3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc28Q80XJ3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc28Q80XJ3 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc28Q80XJ3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc28Q80XJ3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc28Q80XJ3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc28Q80XJ3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc28Q80XJ3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc28Q80XJ3 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc28Q80XJ3 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc28Q80XJ3 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc28Q80XJ3 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc28Q80XJ3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc28Q80XJ3 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc28Q80XJ3 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc28Q80XJ3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc28Q80XJ3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc28Q80XJ3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ttc28Q80XJ3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc28Q80XJ3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc28Q80XJ3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc28Q80XJ3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc28Q80XJ3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc28Q80XJ3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc28Q80XJ3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc28Q80XJ3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc28Q80XJ3 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc28Q80XJ3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc28Q80XJ3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc28Q80XJ3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc28Q80XJ3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc28Q80XJ3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc28Q80XJ3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc28Q80XJ3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ttc28Q80XJ3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc28Q80XJ3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc28Q80XJ3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc28Q80XJ3 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc28Q80XJ3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc28Q80XJ3 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ttc28Q80XJ3 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms