Protein–RNA interactions for Protein: Q80VL3

Prickle3, Prickle planar cell polarity protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prickle3Q80VL3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prickle3Q80VL3 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prickle3Q80VL3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prickle3Q80VL3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prickle3Q80VL3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prickle3Q80VL3 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prickle3Q80VL3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prickle3Q80VL3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prickle3Q80VL3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prickle3Q80VL3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prickle3Q80VL3 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prickle3Q80VL3 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prickle3Q80VL3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prickle3Q80VL3 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Prickle3Q80VL3 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prickle3Q80VL3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prickle3Q80VL3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Prickle3Q80VL3 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prickle3Q80VL3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prickle3Q80VL3 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prickle3Q80VL3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prickle3Q80VL3 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Prickle3Q80VL3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prickle3Q80VL3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prickle3Q80VL3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prickle3Q80VL3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prickle3Q80VL3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prickle3Q80VL3 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Prickle3Q80VL3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Prickle3Q80VL3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prickle3Q80VL3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prickle3Q80VL3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prickle3Q80VL3 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prickle3Q80VL3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prickle3Q80VL3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prickle3Q80VL3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prickle3Q80VL3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prickle3Q80VL3 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prickle3Q80VL3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prickle3Q80VL3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prickle3Q80VL3 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prickle3Q80VL3 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prickle3Q80VL3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prickle3Q80VL3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prickle3Q80VL3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prickle3Q80VL3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prickle3Q80VL3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prickle3Q80VL3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prickle3Q80VL3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prickle3Q80VL3 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prickle3Q80VL3 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prickle3Q80VL3 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prickle3Q80VL3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prickle3Q80VL3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prickle3Q80VL3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prickle3Q80VL3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prickle3Q80VL3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prickle3Q80VL3 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prickle3Q80VL3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Prickle3Q80VL3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prickle3Q80VL3 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prickle3Q80VL3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Prickle3Q80VL3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prickle3Q80VL3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Prickle3Q80VL3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prickle3Q80VL3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prickle3Q80VL3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prickle3Q80VL3 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prickle3Q80VL3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prickle3Q80VL3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prickle3Q80VL3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prickle3Q80VL3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prickle3Q80VL3 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prickle3Q80VL3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prickle3Q80VL3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prickle3Q80VL3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prickle3Q80VL3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prickle3Q80VL3 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prickle3Q80VL3 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prickle3Q80VL3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prickle3Q80VL3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prickle3Q80VL3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prickle3Q80VL3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prickle3Q80VL3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prickle3Q80VL3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prickle3Q80VL3 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prickle3Q80VL3 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prickle3Q80VL3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prickle3Q80VL3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prickle3Q80VL3 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prickle3Q80VL3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prickle3Q80VL3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prickle3Q80VL3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prickle3Q80VL3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prickle3Q80VL3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prickle3Q80VL3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prickle3Q80VL3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prickle3Q80VL3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prickle3Q80VL3 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prickle3Q80VL3 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms