Protein–RNA interactions for Protein: Q80UK0

Sestd1, SEC14 domain and spectrin repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sestd1Q80UK0 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Sestd1Q80UK0 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Sestd1Q80UK0 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sestd1Q80UK0 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sestd1Q80UK0 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sestd1Q80UK0 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sestd1Q80UK0 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sestd1Q80UK0 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sestd1Q80UK0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sestd1Q80UK0 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
Sestd1Q80UK0 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sestd1Q80UK0 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sestd1Q80UK0 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sestd1Q80UK0 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sestd1Q80UK0 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sestd1Q80UK0 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sestd1Q80UK0 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Sestd1Q80UK0 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sestd1Q80UK0 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sestd1Q80UK0 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Sestd1Q80UK0 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sestd1Q80UK0 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sestd1Q80UK0 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sestd1Q80UK0 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sestd1Q80UK0 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sestd1Q80UK0 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sestd1Q80UK0 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sestd1Q80UK0 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sestd1Q80UK0 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sestd1Q80UK0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sestd1Q80UK0 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Sestd1Q80UK0 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sestd1Q80UK0 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sestd1Q80UK0 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sestd1Q80UK0 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sestd1Q80UK0 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sestd1Q80UK0 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sestd1Q80UK0 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sestd1Q80UK0 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sestd1Q80UK0 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sestd1Q80UK0 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sestd1Q80UK0 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sestd1Q80UK0 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Sestd1Q80UK0 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Sestd1Q80UK0 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sestd1Q80UK0 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sestd1Q80UK0 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Sestd1Q80UK0 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sestd1Q80UK0 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sestd1Q80UK0 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sestd1Q80UK0 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sestd1Q80UK0 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Sestd1Q80UK0 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sestd1Q80UK0 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sestd1Q80UK0 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sestd1Q80UK0 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sestd1Q80UK0 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sestd1Q80UK0 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sestd1Q80UK0 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sestd1Q80UK0 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sestd1Q80UK0 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sestd1Q80UK0 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sestd1Q80UK0 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sestd1Q80UK0 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sestd1Q80UK0 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sestd1Q80UK0 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sestd1Q80UK0 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sestd1Q80UK0 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sestd1Q80UK0 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sestd1Q80UK0 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sestd1Q80UK0 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sestd1Q80UK0 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sestd1Q80UK0 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Sestd1Q80UK0 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Sestd1Q80UK0 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sestd1Q80UK0 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Sestd1Q80UK0 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sestd1Q80UK0 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sestd1Q80UK0 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sestd1Q80UK0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sestd1Q80UK0 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sestd1Q80UK0 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sestd1Q80UK0 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sestd1Q80UK0 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sestd1Q80UK0 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sestd1Q80UK0 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sestd1Q80UK0 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sestd1Q80UK0 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sestd1Q80UK0 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sestd1Q80UK0 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sestd1Q80UK0 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sestd1Q80UK0 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sestd1Q80UK0 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sestd1Q80UK0 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sestd1Q80UK0 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sestd1Q80UK0 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sestd1Q80UK0 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sestd1Q80UK0 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Sestd1Q80UK0 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sestd1Q80UK0 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms