Protein–RNA interactions for Protein: Q80U95

Ube3c, Ubiquitin-protein ligase E3C, mousemouse

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3cQ80U95 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ube3cQ80U95 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ube3cQ80U95 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ube3cQ80U95 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ube3cQ80U95 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ube3cQ80U95 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ube3cQ80U95 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ube3cQ80U95 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ube3cQ80U95 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ube3cQ80U95 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ube3cQ80U95 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ube3cQ80U95 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ube3cQ80U95 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ube3cQ80U95 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ube3cQ80U95 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ube3cQ80U95 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ube3cQ80U95 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ube3cQ80U95 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ube3cQ80U95 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ube3cQ80U95 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ube3cQ80U95 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ube3cQ80U95 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ube3cQ80U95 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ube3cQ80U95 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ube3cQ80U95 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ube3cQ80U95 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ube3cQ80U95 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ube3cQ80U95 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ube3cQ80U95 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ube3cQ80U95 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ube3cQ80U95 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ube3cQ80U95 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ube3cQ80U95 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ube3cQ80U95 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ube3cQ80U95 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ube3cQ80U95 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ube3cQ80U95 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ube3cQ80U95 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ube3cQ80U95 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ube3cQ80U95 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ube3cQ80U95 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ube3cQ80U95 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ube3cQ80U95 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ube3cQ80U95 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ube3cQ80U95 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ube3cQ80U95 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ube3cQ80U95 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ube3cQ80U95 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ube3cQ80U95 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ube3cQ80U95 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ube3cQ80U95 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ube3cQ80U95 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ube3cQ80U95 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ube3cQ80U95 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ube3cQ80U95 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ube3cQ80U95 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ube3cQ80U95 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ube3cQ80U95 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ube3cQ80U95 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ube3cQ80U95 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ube3cQ80U95 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ube3cQ80U95 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ube3cQ80U95 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ube3cQ80U95 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ube3cQ80U95 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ube3cQ80U95 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ube3cQ80U95 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ube3cQ80U95 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ube3cQ80U95 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ube3cQ80U95 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ube3cQ80U95 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ube3cQ80U95 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ube3cQ80U95 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ube3cQ80U95 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ube3cQ80U95 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ube3cQ80U95 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ube3cQ80U95 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ube3cQ80U95 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ube3cQ80U95 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ube3cQ80U95 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ube3cQ80U95 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ube3cQ80U95 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ube3cQ80U95 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ube3cQ80U95 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ube3cQ80U95 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ube3cQ80U95 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ube3cQ80U95 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ube3cQ80U95 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ube3cQ80U95 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ube3cQ80U95 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ube3cQ80U95 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ube3cQ80U95 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ube3cQ80U95 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ube3cQ80U95 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ube3cQ80U95 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ube3cQ80U95 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ube3cQ80U95 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ube3cQ80U95 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ube3cQ80U95 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ube3cQ80U95 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms