Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Avl9Q80U56 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Avl9Q80U56 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Avl9Q80U56 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Avl9Q80U56 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Avl9Q80U56 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Avl9Q80U56 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Avl9Q80U56 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Avl9Q80U56 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Avl9Q80U56 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Avl9Q80U56 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Avl9Q80U56 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Avl9Q80U56 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Avl9Q80U56 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Avl9Q80U56 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Avl9Q80U56 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Avl9Q80U56 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Avl9Q80U56 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Avl9Q80U56 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Avl9Q80U56 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Avl9Q80U56 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Avl9Q80U56 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Avl9Q80U56 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Avl9Q80U56 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Avl9Q80U56 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Avl9Q80U56 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Avl9Q80U56 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Avl9Q80U56 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Avl9Q80U56 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Avl9Q80U56 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Avl9Q80U56 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Avl9Q80U56 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Avl9Q80U56 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Avl9Q80U56 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Avl9Q80U56 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Avl9Q80U56 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Avl9Q80U56 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Avl9Q80U56 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Avl9Q80U56 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Avl9Q80U56 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Avl9Q80U56 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Avl9Q80U56 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Avl9Q80U56 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Avl9Q80U56 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Avl9Q80U56 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Avl9Q80U56 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Avl9Q80U56 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Avl9Q80U56 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Avl9Q80U56 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Avl9Q80U56 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Avl9Q80U56 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Avl9Q80U56 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Avl9Q80U56 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Avl9Q80U56 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Avl9Q80U56 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Avl9Q80U56 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Avl9Q80U56 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Avl9Q80U56 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Avl9Q80U56 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Avl9Q80U56 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Avl9Q80U56 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Avl9Q80U56 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Avl9Q80U56 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Avl9Q80U56 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Avl9Q80U56 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Avl9Q80U56 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Avl9Q80U56 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Avl9Q80U56 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Avl9Q80U56 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Avl9Q80U56 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Avl9Q80U56 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Avl9Q80U56 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Avl9Q80U56 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Avl9Q80U56 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Avl9Q80U56 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Avl9Q80U56 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Avl9Q80U56 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Avl9Q80U56 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Avl9Q80U56 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Avl9Q80U56 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Avl9Q80U56 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Avl9Q80U56 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Avl9Q80U56 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Avl9Q80U56 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Avl9Q80U56 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Avl9Q80U56 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Avl9Q80U56 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Avl9Q80U56 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Avl9Q80U56 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Avl9Q80U56 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Avl9Q80U56 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Avl9Q80U56 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Avl9Q80U56 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Avl9Q80U56 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Avl9Q80U56 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Avl9Q80U56 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Avl9Q80U56 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Avl9Q80U56 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Avl9Q80U56 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Avl9Q80U56 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms