Protein–RNA interactions for Protein: Q7TST5

Lamp3, Lysosome-associated membrane glycoprotein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp3Q7TST5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lamp3Q7TST5 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lamp3Q7TST5 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Lamp3Q7TST5 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lamp3Q7TST5 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lamp3Q7TST5 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lamp3Q7TST5 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lamp3Q7TST5 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lamp3Q7TST5 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lamp3Q7TST5 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lamp3Q7TST5 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lamp3Q7TST5 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lamp3Q7TST5 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lamp3Q7TST5 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lamp3Q7TST5 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lamp3Q7TST5 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lamp3Q7TST5 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lamp3Q7TST5 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lamp3Q7TST5 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lamp3Q7TST5 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lamp3Q7TST5 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Lamp3Q7TST5 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lamp3Q7TST5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lamp3Q7TST5 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lamp3Q7TST5 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lamp3Q7TST5 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Lamp3Q7TST5 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lamp3Q7TST5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lamp3Q7TST5 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lamp3Q7TST5 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lamp3Q7TST5 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lamp3Q7TST5 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lamp3Q7TST5 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lamp3Q7TST5 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lamp3Q7TST5 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lamp3Q7TST5 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lamp3Q7TST5 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lamp3Q7TST5 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lamp3Q7TST5 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lamp3Q7TST5 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lamp3Q7TST5 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Lamp3Q7TST5 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lamp3Q7TST5 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lamp3Q7TST5 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Lamp3Q7TST5 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lamp3Q7TST5 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lamp3Q7TST5 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Lamp3Q7TST5 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lamp3Q7TST5 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Lamp3Q7TST5 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lamp3Q7TST5 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lamp3Q7TST5 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lamp3Q7TST5 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lamp3Q7TST5 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lamp3Q7TST5 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lamp3Q7TST5 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lamp3Q7TST5 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lamp3Q7TST5 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lamp3Q7TST5 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lamp3Q7TST5 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lamp3Q7TST5 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lamp3Q7TST5 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lamp3Q7TST5 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lamp3Q7TST5 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lamp3Q7TST5 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lamp3Q7TST5 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lamp3Q7TST5 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lamp3Q7TST5 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lamp3Q7TST5 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lamp3Q7TST5 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lamp3Q7TST5 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lamp3Q7TST5 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lamp3Q7TST5 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lamp3Q7TST5 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lamp3Q7TST5 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lamp3Q7TST5 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lamp3Q7TST5 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lamp3Q7TST5 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lamp3Q7TST5 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lamp3Q7TST5 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lamp3Q7TST5 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lamp3Q7TST5 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lamp3Q7TST5 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Lamp3Q7TST5 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Lamp3Q7TST5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lamp3Q7TST5 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lamp3Q7TST5 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lamp3Q7TST5 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lamp3Q7TST5 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lamp3Q7TST5 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lamp3Q7TST5 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lamp3Q7TST5 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lamp3Q7TST5 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lamp3Q7TST5 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lamp3Q7TST5 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lamp3Q7TST5 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lamp3Q7TST5 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lamp3Q7TST5 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lamp3Q7TST5 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lamp3Q7TST5 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.8 ms