Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSL0

Ifnk, Interferon kappa, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfnkQ7TSL0 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IfnkQ7TSL0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IfnkQ7TSL0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IfnkQ7TSL0 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
IfnkQ7TSL0 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IfnkQ7TSL0 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IfnkQ7TSL0 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IfnkQ7TSL0 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IfnkQ7TSL0 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IfnkQ7TSL0 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IfnkQ7TSL0 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IfnkQ7TSL0 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IfnkQ7TSL0 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IfnkQ7TSL0 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IfnkQ7TSL0 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IfnkQ7TSL0 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IfnkQ7TSL0 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IfnkQ7TSL0 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
IfnkQ7TSL0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IfnkQ7TSL0 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IfnkQ7TSL0 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IfnkQ7TSL0 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
IfnkQ7TSL0 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IfnkQ7TSL0 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IfnkQ7TSL0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IfnkQ7TSL0 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IfnkQ7TSL0 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IfnkQ7TSL0 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
IfnkQ7TSL0 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IfnkQ7TSL0 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IfnkQ7TSL0 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IfnkQ7TSL0 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IfnkQ7TSL0 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IfnkQ7TSL0 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IfnkQ7TSL0 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IfnkQ7TSL0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IfnkQ7TSL0 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IfnkQ7TSL0 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IfnkQ7TSL0 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IfnkQ7TSL0 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IfnkQ7TSL0 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IfnkQ7TSL0 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IfnkQ7TSL0 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IfnkQ7TSL0 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IfnkQ7TSL0 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IfnkQ7TSL0 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IfnkQ7TSL0 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IfnkQ7TSL0 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IfnkQ7TSL0 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IfnkQ7TSL0 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IfnkQ7TSL0 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
IfnkQ7TSL0 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IfnkQ7TSL0 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IfnkQ7TSL0 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IfnkQ7TSL0 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IfnkQ7TSL0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IfnkQ7TSL0 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IfnkQ7TSL0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IfnkQ7TSL0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IfnkQ7TSL0 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
IfnkQ7TSL0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
IfnkQ7TSL0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IfnkQ7TSL0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IfnkQ7TSL0 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IfnkQ7TSL0 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IfnkQ7TSL0 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IfnkQ7TSL0 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IfnkQ7TSL0 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IfnkQ7TSL0 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IfnkQ7TSL0 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IfnkQ7TSL0 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IfnkQ7TSL0 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IfnkQ7TSL0 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IfnkQ7TSL0 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IfnkQ7TSL0 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IfnkQ7TSL0 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IfnkQ7TSL0 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IfnkQ7TSL0 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IfnkQ7TSL0 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IfnkQ7TSL0 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IfnkQ7TSL0 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IfnkQ7TSL0 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IfnkQ7TSL0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IfnkQ7TSL0 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IfnkQ7TSL0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IfnkQ7TSL0 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
IfnkQ7TSL0 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IfnkQ7TSL0 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IfnkQ7TSL0 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IfnkQ7TSL0 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IfnkQ7TSL0 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IfnkQ7TSL0 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IfnkQ7TSL0 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IfnkQ7TSL0 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IfnkQ7TSL0 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IfnkQ7TSL0 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IfnkQ7TSL0 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IfnkQ7TSL0 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IfnkQ7TSL0 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IfnkQ7TSL0 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms