Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Actn1Q7TPR4 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Actn1Q7TPR4 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Actn1Q7TPR4 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Actn1Q7TPR4 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Actn1Q7TPR4 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Actn1Q7TPR4 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Actn1Q7TPR4 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Actn1Q7TPR4 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Actn1Q7TPR4 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Actn1Q7TPR4 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Actn1Q7TPR4 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Actn1Q7TPR4 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Actn1Q7TPR4 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Actn1Q7TPR4 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Actn1Q7TPR4 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Actn1Q7TPR4 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Actn1Q7TPR4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Actn1Q7TPR4 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Actn1Q7TPR4 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Actn1Q7TPR4 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Actn1Q7TPR4 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Actn1Q7TPR4 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Actn1Q7TPR4 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Actn1Q7TPR4 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Actn1Q7TPR4 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Actn1Q7TPR4 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Actn1Q7TPR4 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Actn1Q7TPR4 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Actn1Q7TPR4 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Actn1Q7TPR4 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Actn1Q7TPR4 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Actn1Q7TPR4 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Actn1Q7TPR4 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Actn1Q7TPR4 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Actn1Q7TPR4 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Actn1Q7TPR4 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Actn1Q7TPR4 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Actn1Q7TPR4 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Actn1Q7TPR4 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Actn1Q7TPR4 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Actn1Q7TPR4 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Actn1Q7TPR4 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Actn1Q7TPR4 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Actn1Q7TPR4 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Actn1Q7TPR4 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Actn1Q7TPR4 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Actn1Q7TPR4 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Actn1Q7TPR4 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Actn1Q7TPR4 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Actn1Q7TPR4 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Actn1Q7TPR4 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Actn1Q7TPR4 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Actn1Q7TPR4 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Actn1Q7TPR4 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Actn1Q7TPR4 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Actn1Q7TPR4 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Actn1Q7TPR4 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Actn1Q7TPR4 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Actn1Q7TPR4 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Actn1Q7TPR4 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Actn1Q7TPR4 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Actn1Q7TPR4 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Actn1Q7TPR4 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Actn1Q7TPR4 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Actn1Q7TPR4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Actn1Q7TPR4 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Actn1Q7TPR4 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Actn1Q7TPR4 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Actn1Q7TPR4 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Actn1Q7TPR4 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Actn1Q7TPR4 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Actn1Q7TPR4 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Actn1Q7TPR4 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Actn1Q7TPR4 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Actn1Q7TPR4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Actn1Q7TPR4 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Actn1Q7TPR4 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Actn1Q7TPR4 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Actn1Q7TPR4 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Actn1Q7TPR4 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Actn1Q7TPR4 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Actn1Q7TPR4 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Actn1Q7TPR4 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Actn1Q7TPR4 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Actn1Q7TPR4 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Actn1Q7TPR4 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Actn1Q7TPR4 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Actn1Q7TPR4 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Actn1Q7TPR4 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Actn1Q7TPR4 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Actn1Q7TPR4 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Actn1Q7TPR4 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Actn1Q7TPR4 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Actn1Q7TPR4 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Actn1Q7TPR4 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Actn1Q7TPR4 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Actn1Q7TPR4 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Actn1Q7TPR4 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Actn1Q7TPR4 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms