Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNB8

Sbno2, Protein strawberry notch homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno2Q7TNB8 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sbno2Q7TNB8 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sbno2Q7TNB8 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sbno2Q7TNB8 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sbno2Q7TNB8 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sbno2Q7TNB8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sbno2Q7TNB8 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sbno2Q7TNB8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sbno2Q7TNB8 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Sbno2Q7TNB8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sbno2Q7TNB8 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sbno2Q7TNB8 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sbno2Q7TNB8 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sbno2Q7TNB8 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sbno2Q7TNB8 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sbno2Q7TNB8 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sbno2Q7TNB8 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Sbno2Q7TNB8 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sbno2Q7TNB8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sbno2Q7TNB8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sbno2Q7TNB8 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sbno2Q7TNB8 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sbno2Q7TNB8 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Sbno2Q7TNB8 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Sbno2Q7TNB8 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sbno2Q7TNB8 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Sbno2Q7TNB8 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sbno2Q7TNB8 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sbno2Q7TNB8 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sbno2Q7TNB8 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Sbno2Q7TNB8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sbno2Q7TNB8 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sbno2Q7TNB8 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sbno2Q7TNB8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sbno2Q7TNB8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sbno2Q7TNB8 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sbno2Q7TNB8 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sbno2Q7TNB8 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sbno2Q7TNB8 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sbno2Q7TNB8 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sbno2Q7TNB8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sbno2Q7TNB8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sbno2Q7TNB8 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sbno2Q7TNB8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sbno2Q7TNB8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sbno2Q7TNB8 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Sbno2Q7TNB8 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sbno2Q7TNB8 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sbno2Q7TNB8 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sbno2Q7TNB8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sbno2Q7TNB8 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sbno2Q7TNB8 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sbno2Q7TNB8 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sbno2Q7TNB8 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sbno2Q7TNB8 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sbno2Q7TNB8 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sbno2Q7TNB8 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Sbno2Q7TNB8 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sbno2Q7TNB8 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Sbno2Q7TNB8 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sbno2Q7TNB8 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Sbno2Q7TNB8 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sbno2Q7TNB8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sbno2Q7TNB8 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sbno2Q7TNB8 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sbno2Q7TNB8 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sbno2Q7TNB8 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sbno2Q7TNB8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sbno2Q7TNB8 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sbno2Q7TNB8 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sbno2Q7TNB8 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sbno2Q7TNB8 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sbno2Q7TNB8 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sbno2Q7TNB8 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Sbno2Q7TNB8 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sbno2Q7TNB8 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sbno2Q7TNB8 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sbno2Q7TNB8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sbno2Q7TNB8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sbno2Q7TNB8 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sbno2Q7TNB8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sbno2Q7TNB8 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sbno2Q7TNB8 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sbno2Q7TNB8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sbno2Q7TNB8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sbno2Q7TNB8 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Sbno2Q7TNB8 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sbno2Q7TNB8 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Sbno2Q7TNB8 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sbno2Q7TNB8 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sbno2Q7TNB8 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sbno2Q7TNB8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sbno2Q7TNB8 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sbno2Q7TNB8 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sbno2Q7TNB8 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sbno2Q7TNB8 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sbno2Q7TNB8 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sbno2Q7TNB8 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sbno2Q7TNB8 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sbno2Q7TNB8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms