Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TwistnbQ78WZ7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TwistnbQ78WZ7 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TwistnbQ78WZ7 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TwistnbQ78WZ7 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TwistnbQ78WZ7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TwistnbQ78WZ7 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TwistnbQ78WZ7 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TwistnbQ78WZ7 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TwistnbQ78WZ7 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TwistnbQ78WZ7 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TwistnbQ78WZ7 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TwistnbQ78WZ7 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TwistnbQ78WZ7 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TwistnbQ78WZ7 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TwistnbQ78WZ7 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TwistnbQ78WZ7 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TwistnbQ78WZ7 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TwistnbQ78WZ7 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TwistnbQ78WZ7 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TwistnbQ78WZ7 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TwistnbQ78WZ7 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TwistnbQ78WZ7 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TwistnbQ78WZ7 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TwistnbQ78WZ7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TwistnbQ78WZ7 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TwistnbQ78WZ7 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TwistnbQ78WZ7 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TwistnbQ78WZ7 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TwistnbQ78WZ7 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TwistnbQ78WZ7 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TwistnbQ78WZ7 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TwistnbQ78WZ7 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TwistnbQ78WZ7 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TwistnbQ78WZ7 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TwistnbQ78WZ7 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TwistnbQ78WZ7 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TwistnbQ78WZ7 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TwistnbQ78WZ7 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TwistnbQ78WZ7 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TwistnbQ78WZ7 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TwistnbQ78WZ7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TwistnbQ78WZ7 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TwistnbQ78WZ7 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TwistnbQ78WZ7 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TwistnbQ78WZ7 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TwistnbQ78WZ7 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TwistnbQ78WZ7 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TwistnbQ78WZ7 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TwistnbQ78WZ7 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TwistnbQ78WZ7 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TwistnbQ78WZ7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TwistnbQ78WZ7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TwistnbQ78WZ7 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TwistnbQ78WZ7 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TwistnbQ78WZ7 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TwistnbQ78WZ7 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TwistnbQ78WZ7 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TwistnbQ78WZ7 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TwistnbQ78WZ7 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TwistnbQ78WZ7 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TwistnbQ78WZ7 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TwistnbQ78WZ7 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TwistnbQ78WZ7 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TwistnbQ78WZ7 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TwistnbQ78WZ7 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TwistnbQ78WZ7 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TwistnbQ78WZ7 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TwistnbQ78WZ7 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TwistnbQ78WZ7 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TwistnbQ78WZ7 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TwistnbQ78WZ7 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TwistnbQ78WZ7 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TwistnbQ78WZ7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TwistnbQ78WZ7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TwistnbQ78WZ7 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TwistnbQ78WZ7 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TwistnbQ78WZ7 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TwistnbQ78WZ7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TwistnbQ78WZ7 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TwistnbQ78WZ7 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TwistnbQ78WZ7 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TwistnbQ78WZ7 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TwistnbQ78WZ7 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TwistnbQ78WZ7 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TwistnbQ78WZ7 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TwistnbQ78WZ7 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TwistnbQ78WZ7 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TwistnbQ78WZ7 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TwistnbQ78WZ7 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TwistnbQ78WZ7 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TwistnbQ78WZ7 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TwistnbQ78WZ7 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TwistnbQ78WZ7 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TwistnbQ78WZ7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TwistnbQ78WZ7 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TwistnbQ78WZ7 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TwistnbQ78WZ7 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TwistnbQ78WZ7 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TwistnbQ78WZ7 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms