Protein–RNA interactions for Protein: Q78S06

Sys1, Protein SYS1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sys1Q78S06 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sys1Q78S06 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sys1Q78S06 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sys1Q78S06 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sys1Q78S06 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sys1Q78S06 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sys1Q78S06 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sys1Q78S06 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sys1Q78S06 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sys1Q78S06 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Sys1Q78S06 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sys1Q78S06 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sys1Q78S06 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sys1Q78S06 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sys1Q78S06 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sys1Q78S06 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sys1Q78S06 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sys1Q78S06 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sys1Q78S06 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sys1Q78S06 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sys1Q78S06 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sys1Q78S06 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sys1Q78S06 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sys1Q78S06 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sys1Q78S06 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sys1Q78S06 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sys1Q78S06 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sys1Q78S06 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sys1Q78S06 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sys1Q78S06 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sys1Q78S06 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sys1Q78S06 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sys1Q78S06 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sys1Q78S06 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sys1Q78S06 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sys1Q78S06 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sys1Q78S06 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sys1Q78S06 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Sys1Q78S06 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sys1Q78S06 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sys1Q78S06 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Sys1Q78S06 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sys1Q78S06 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sys1Q78S06 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sys1Q78S06 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sys1Q78S06 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sys1Q78S06 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sys1Q78S06 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sys1Q78S06 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sys1Q78S06 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sys1Q78S06 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sys1Q78S06 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sys1Q78S06 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Sys1Q78S06 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Sys1Q78S06 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sys1Q78S06 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Sys1Q78S06 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sys1Q78S06 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sys1Q78S06 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Sys1Q78S06 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sys1Q78S06 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Sys1Q78S06 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Sys1Q78S06 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sys1Q78S06 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sys1Q78S06 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sys1Q78S06 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sys1Q78S06 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sys1Q78S06 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sys1Q78S06 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sys1Q78S06 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sys1Q78S06 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Sys1Q78S06 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sys1Q78S06 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sys1Q78S06 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sys1Q78S06 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sys1Q78S06 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sys1Q78S06 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sys1Q78S06 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sys1Q78S06 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sys1Q78S06 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Sys1Q78S06 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sys1Q78S06 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sys1Q78S06 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sys1Q78S06 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sys1Q78S06 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sys1Q78S06 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Sys1Q78S06 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Sys1Q78S06 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sys1Q78S06 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sys1Q78S06 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sys1Q78S06 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sys1Q78S06 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sys1Q78S06 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sys1Q78S06 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sys1Q78S06 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sys1Q78S06 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sys1Q78S06 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sys1Q78S06 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sys1Q78S06 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sys1Q78S06 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms