Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmed3Q78IS1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmed3Q78IS1 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmed3Q78IS1 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmed3Q78IS1 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmed3Q78IS1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmed3Q78IS1 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmed3Q78IS1 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmed3Q78IS1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmed3Q78IS1 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmed3Q78IS1 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmed3Q78IS1 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmed3Q78IS1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmed3Q78IS1 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmed3Q78IS1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmed3Q78IS1 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmed3Q78IS1 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmed3Q78IS1 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmed3Q78IS1 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmed3Q78IS1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmed3Q78IS1 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmed3Q78IS1 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmed3Q78IS1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmed3Q78IS1 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmed3Q78IS1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmed3Q78IS1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmed3Q78IS1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmed3Q78IS1 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmed3Q78IS1 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmed3Q78IS1 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmed3Q78IS1 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmed3Q78IS1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmed3Q78IS1 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmed3Q78IS1 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmed3Q78IS1 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmed3Q78IS1 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmed3Q78IS1 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmed3Q78IS1 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmed3Q78IS1 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmed3Q78IS1 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmed3Q78IS1 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmed3Q78IS1 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmed3Q78IS1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmed3Q78IS1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmed3Q78IS1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmed3Q78IS1 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmed3Q78IS1 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmed3Q78IS1 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmed3Q78IS1 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmed3Q78IS1 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmed3Q78IS1 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmed3Q78IS1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmed3Q78IS1 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmed3Q78IS1 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmed3Q78IS1 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmed3Q78IS1 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmed3Q78IS1 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmed3Q78IS1 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmed3Q78IS1 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmed3Q78IS1 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmed3Q78IS1 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmed3Q78IS1 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmed3Q78IS1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmed3Q78IS1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmed3Q78IS1 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmed3Q78IS1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmed3Q78IS1 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmed3Q78IS1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmed3Q78IS1 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmed3Q78IS1 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmed3Q78IS1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmed3Q78IS1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmed3Q78IS1 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmed3Q78IS1 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmed3Q78IS1 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmed3Q78IS1 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmed3Q78IS1 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmed3Q78IS1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmed3Q78IS1 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmed3Q78IS1 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmed3Q78IS1 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmed3Q78IS1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmed3Q78IS1 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmed3Q78IS1 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmed3Q78IS1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmed3Q78IS1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmed3Q78IS1 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmed3Q78IS1 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmed3Q78IS1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmed3Q78IS1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmed3Q78IS1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmed3Q78IS1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmed3Q78IS1 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmed3Q78IS1 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmed3Q78IS1 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmed3Q78IS1 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmed3Q78IS1 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmed3Q78IS1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmed3Q78IS1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmed3Q78IS1 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms