Protein–RNA interactions for Protein: Q70E20

Sned1, Sushi, nidogen and EGF-like domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sned1Q70E20 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sned1Q70E20 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sned1Q70E20 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sned1Q70E20 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sned1Q70E20 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sned1Q70E20 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sned1Q70E20 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sned1Q70E20 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sned1Q70E20 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sned1Q70E20 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sned1Q70E20 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sned1Q70E20 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sned1Q70E20 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Sned1Q70E20 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sned1Q70E20 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sned1Q70E20 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sned1Q70E20 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sned1Q70E20 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sned1Q70E20 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sned1Q70E20 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sned1Q70E20 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sned1Q70E20 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sned1Q70E20 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sned1Q70E20 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sned1Q70E20 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sned1Q70E20 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sned1Q70E20 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sned1Q70E20 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sned1Q70E20 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sned1Q70E20 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sned1Q70E20 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sned1Q70E20 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sned1Q70E20 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sned1Q70E20 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sned1Q70E20 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sned1Q70E20 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sned1Q70E20 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sned1Q70E20 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sned1Q70E20 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sned1Q70E20 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sned1Q70E20 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sned1Q70E20 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sned1Q70E20 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Sned1Q70E20 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sned1Q70E20 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sned1Q70E20 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Sned1Q70E20 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sned1Q70E20 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sned1Q70E20 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sned1Q70E20 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sned1Q70E20 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Sned1Q70E20 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sned1Q70E20 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sned1Q70E20 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Sned1Q70E20 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sned1Q70E20 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Sned1Q70E20 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sned1Q70E20 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Sned1Q70E20 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sned1Q70E20 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sned1Q70E20 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sned1Q70E20 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sned1Q70E20 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sned1Q70E20 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sned1Q70E20 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sned1Q70E20 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sned1Q70E20 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sned1Q70E20 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Sned1Q70E20 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Sned1Q70E20 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sned1Q70E20 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sned1Q70E20 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sned1Q70E20 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sned1Q70E20 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sned1Q70E20 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sned1Q70E20 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sned1Q70E20 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sned1Q70E20 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sned1Q70E20 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sned1Q70E20 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sned1Q70E20 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sned1Q70E20 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sned1Q70E20 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sned1Q70E20 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sned1Q70E20 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sned1Q70E20 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sned1Q70E20 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Sned1Q70E20 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sned1Q70E20 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sned1Q70E20 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sned1Q70E20 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sned1Q70E20 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sned1Q70E20 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Sned1Q70E20 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Sned1Q70E20 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sned1Q70E20 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sned1Q70E20 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sned1Q70E20 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sned1Q70E20 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sned1Q70E20 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms