Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnih3Q6ZWS4 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnih3Q6ZWS4 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnih3Q6ZWS4 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnih3Q6ZWS4 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnih3Q6ZWS4 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnih3Q6ZWS4 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnih3Q6ZWS4 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnih3Q6ZWS4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnih3Q6ZWS4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnih3Q6ZWS4 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnih3Q6ZWS4 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnih3Q6ZWS4 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnih3Q6ZWS4 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnih3Q6ZWS4 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnih3Q6ZWS4 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnih3Q6ZWS4 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnih3Q6ZWS4 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnih3Q6ZWS4 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnih3Q6ZWS4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnih3Q6ZWS4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnih3Q6ZWS4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnih3Q6ZWS4 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnih3Q6ZWS4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnih3Q6ZWS4 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnih3Q6ZWS4 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnih3Q6ZWS4 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnih3Q6ZWS4 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnih3Q6ZWS4 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnih3Q6ZWS4 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnih3Q6ZWS4 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnih3Q6ZWS4 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnih3Q6ZWS4 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnih3Q6ZWS4 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnih3Q6ZWS4 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnih3Q6ZWS4 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnih3Q6ZWS4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnih3Q6ZWS4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnih3Q6ZWS4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnih3Q6ZWS4 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnih3Q6ZWS4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnih3Q6ZWS4 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnih3Q6ZWS4 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnih3Q6ZWS4 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnih3Q6ZWS4 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnih3Q6ZWS4 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnih3Q6ZWS4 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnih3Q6ZWS4 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnih3Q6ZWS4 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnih3Q6ZWS4 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cnih3Q6ZWS4 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnih3Q6ZWS4 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnih3Q6ZWS4 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnih3Q6ZWS4 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnih3Q6ZWS4 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnih3Q6ZWS4 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnih3Q6ZWS4 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnih3Q6ZWS4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnih3Q6ZWS4 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnih3Q6ZWS4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnih3Q6ZWS4 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnih3Q6ZWS4 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnih3Q6ZWS4 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnih3Q6ZWS4 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnih3Q6ZWS4 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnih3Q6ZWS4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnih3Q6ZWS4 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnih3Q6ZWS4 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnih3Q6ZWS4 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnih3Q6ZWS4 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnih3Q6ZWS4 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cnih3Q6ZWS4 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cnih3Q6ZWS4 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cnih3Q6ZWS4 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cnih3Q6ZWS4 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cnih3Q6ZWS4 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cnih3Q6ZWS4 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cnih3Q6ZWS4 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cnih3Q6ZWS4 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cnih3Q6ZWS4 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cnih3Q6ZWS4 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cnih3Q6ZWS4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cnih3Q6ZWS4 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cnih3Q6ZWS4 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cnih3Q6ZWS4 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cnih3Q6ZWS4 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cnih3Q6ZWS4 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cnih3Q6ZWS4 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cnih3Q6ZWS4 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Cnih3Q6ZWS4 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnih3Q6ZWS4 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnih3Q6ZWS4 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnih3Q6ZWS4 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnih3Q6ZWS4 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnih3Q6ZWS4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnih3Q6ZWS4 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnih3Q6ZWS4 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnih3Q6ZWS4 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnih3Q6ZWS4 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnih3Q6ZWS4 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
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