Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Topbp1Q6ZQF0 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Topbp1Q6ZQF0 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Topbp1Q6ZQF0 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Topbp1Q6ZQF0 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Topbp1Q6ZQF0 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Topbp1Q6ZQF0 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Topbp1Q6ZQF0 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Topbp1Q6ZQF0 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Topbp1Q6ZQF0 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Topbp1Q6ZQF0 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Topbp1Q6ZQF0 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Topbp1Q6ZQF0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Topbp1Q6ZQF0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Topbp1Q6ZQF0 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Topbp1Q6ZQF0 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Topbp1Q6ZQF0 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Topbp1Q6ZQF0 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Topbp1Q6ZQF0 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Topbp1Q6ZQF0 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Topbp1Q6ZQF0 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Topbp1Q6ZQF0 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Topbp1Q6ZQF0 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Topbp1Q6ZQF0 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Topbp1Q6ZQF0 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Topbp1Q6ZQF0 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Topbp1Q6ZQF0 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Topbp1Q6ZQF0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Topbp1Q6ZQF0 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Topbp1Q6ZQF0 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Topbp1Q6ZQF0 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Topbp1Q6ZQF0 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Topbp1Q6ZQF0 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Topbp1Q6ZQF0 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Topbp1Q6ZQF0 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Topbp1Q6ZQF0 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Topbp1Q6ZQF0 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Topbp1Q6ZQF0 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Topbp1Q6ZQF0 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Topbp1Q6ZQF0 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Topbp1Q6ZQF0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Topbp1Q6ZQF0 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Topbp1Q6ZQF0 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Topbp1Q6ZQF0 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Topbp1Q6ZQF0 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Topbp1Q6ZQF0 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Topbp1Q6ZQF0 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Topbp1Q6ZQF0 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
Topbp1Q6ZQF0 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Topbp1Q6ZQF0 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Topbp1Q6ZQF0 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Topbp1Q6ZQF0 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Topbp1Q6ZQF0 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Topbp1Q6ZQF0 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Topbp1Q6ZQF0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Topbp1Q6ZQF0 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Topbp1Q6ZQF0 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Topbp1Q6ZQF0 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Topbp1Q6ZQF0 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Topbp1Q6ZQF0 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Topbp1Q6ZQF0 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Topbp1Q6ZQF0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Topbp1Q6ZQF0 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Topbp1Q6ZQF0 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Topbp1Q6ZQF0 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Topbp1Q6ZQF0 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Topbp1Q6ZQF0 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Topbp1Q6ZQF0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Topbp1Q6ZQF0 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Topbp1Q6ZQF0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Topbp1Q6ZQF0 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Topbp1Q6ZQF0 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Topbp1Q6ZQF0 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Topbp1Q6ZQF0 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Topbp1Q6ZQF0 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Topbp1Q6ZQF0 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Topbp1Q6ZQF0 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Topbp1Q6ZQF0 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Topbp1Q6ZQF0 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Topbp1Q6ZQF0 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Topbp1Q6ZQF0 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Topbp1Q6ZQF0 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Topbp1Q6ZQF0 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Topbp1Q6ZQF0 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Topbp1Q6ZQF0 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Topbp1Q6ZQF0 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Topbp1Q6ZQF0 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Topbp1Q6ZQF0 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Topbp1Q6ZQF0 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Topbp1Q6ZQF0 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Topbp1Q6ZQF0 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Topbp1Q6ZQF0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Topbp1Q6ZQF0 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Topbp1Q6ZQF0 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Topbp1Q6ZQF0 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Topbp1Q6ZQF0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Topbp1Q6ZQF0 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Topbp1Q6ZQF0 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Topbp1Q6ZQF0 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
Topbp1Q6ZQF0 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms