Protein–RNA interactions for Protein: Q6X893

Slc44a1, Choline transporter-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a1Q6X893 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Slc44a1Q6X893 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Slc44a1Q6X893 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Slc44a1Q6X893 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Slc44a1Q6X893 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Slc44a1Q6X893 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Slc44a1Q6X893 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Slc44a1Q6X893 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Slc44a1Q6X893 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Slc44a1Q6X893 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Slc44a1Q6X893 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Slc44a1Q6X893 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Slc44a1Q6X893 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Slc44a1Q6X893 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Slc44a1Q6X893 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Slc44a1Q6X893 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Slc44a1Q6X893 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Slc44a1Q6X893 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Slc44a1Q6X893 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Slc44a1Q6X893 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Slc44a1Q6X893 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Slc44a1Q6X893 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Slc44a1Q6X893 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Slc44a1Q6X893 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Slc44a1Q6X893 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Slc44a1Q6X893 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Slc44a1Q6X893 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Slc44a1Q6X893 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Slc44a1Q6X893 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Slc44a1Q6X893 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Slc44a1Q6X893 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Slc44a1Q6X893 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Slc44a1Q6X893 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Slc44a1Q6X893 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Slc44a1Q6X893 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Slc44a1Q6X893 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Slc44a1Q6X893 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Slc44a1Q6X893 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Slc44a1Q6X893 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Slc44a1Q6X893 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Slc44a1Q6X893 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Slc44a1Q6X893 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Slc44a1Q6X893 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Slc44a1Q6X893 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Slc44a1Q6X893 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Slc44a1Q6X893 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Slc44a1Q6X893 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Slc44a1Q6X893 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Slc44a1Q6X893 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Slc44a1Q6X893 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Slc44a1Q6X893 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Slc44a1Q6X893 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Slc44a1Q6X893 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Slc44a1Q6X893 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Slc44a1Q6X893 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Slc44a1Q6X893 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Slc44a1Q6X893 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Slc44a1Q6X893 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Slc44a1Q6X893 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Slc44a1Q6X893 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Slc44a1Q6X893 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Slc44a1Q6X893 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Slc44a1Q6X893 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Slc44a1Q6X893 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Slc44a1Q6X893 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Slc44a1Q6X893 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Slc44a1Q6X893 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Slc44a1Q6X893 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Slc44a1Q6X893 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Slc44a1Q6X893 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Slc44a1Q6X893 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Slc44a1Q6X893 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Slc44a1Q6X893 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Slc44a1Q6X893 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Slc44a1Q6X893 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Slc44a1Q6X893 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Slc44a1Q6X893 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Slc44a1Q6X893 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Slc44a1Q6X893 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Slc44a1Q6X893 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Slc44a1Q6X893 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Slc44a1Q6X893 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Slc44a1Q6X893 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Slc44a1Q6X893 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Slc44a1Q6X893 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Slc44a1Q6X893 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Slc44a1Q6X893 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Slc44a1Q6X893 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Slc44a1Q6X893 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Slc44a1Q6X893 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Slc44a1Q6X893 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Slc44a1Q6X893 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Slc44a1Q6X893 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Slc44a1Q6X893 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Slc44a1Q6X893 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Slc44a1Q6X893 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Slc44a1Q6X893 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Slc44a1Q6X893 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Slc44a1Q6X893 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Slc44a1Q6X893 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms