Protein–RNA interactions for Protein: Q6VH22

Ift172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift172Q6VH22 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ift172Q6VH22 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ift172Q6VH22 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ift172Q6VH22 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ift172Q6VH22 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ift172Q6VH22 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ift172Q6VH22 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ift172Q6VH22 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ift172Q6VH22 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ift172Q6VH22 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ift172Q6VH22 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Ift172Q6VH22 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ift172Q6VH22 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ift172Q6VH22 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ift172Q6VH22 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ift172Q6VH22 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ift172Q6VH22 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ift172Q6VH22 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ift172Q6VH22 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Ift172Q6VH22 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ift172Q6VH22 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ift172Q6VH22 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ift172Q6VH22 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ift172Q6VH22 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ift172Q6VH22 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ift172Q6VH22 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ift172Q6VH22 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ift172Q6VH22 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ift172Q6VH22 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ift172Q6VH22 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ift172Q6VH22 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Ift172Q6VH22 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ift172Q6VH22 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ift172Q6VH22 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ift172Q6VH22 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ift172Q6VH22 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ift172Q6VH22 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ift172Q6VH22 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Ift172Q6VH22 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Ift172Q6VH22 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ift172Q6VH22 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ift172Q6VH22 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ift172Q6VH22 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ift172Q6VH22 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ift172Q6VH22 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ift172Q6VH22 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ift172Q6VH22 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ift172Q6VH22 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ift172Q6VH22 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ift172Q6VH22 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ift172Q6VH22 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ift172Q6VH22 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ift172Q6VH22 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Ift172Q6VH22 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ift172Q6VH22 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ift172Q6VH22 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ift172Q6VH22 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Ift172Q6VH22 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ift172Q6VH22 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ift172Q6VH22 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ift172Q6VH22 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ift172Q6VH22 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ift172Q6VH22 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ift172Q6VH22 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ift172Q6VH22 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ift172Q6VH22 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ift172Q6VH22 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ift172Q6VH22 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Ift172Q6VH22 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ift172Q6VH22 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ift172Q6VH22 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ift172Q6VH22 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ift172Q6VH22 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ift172Q6VH22 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ift172Q6VH22 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ift172Q6VH22 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ift172Q6VH22 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ift172Q6VH22 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ift172Q6VH22 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ift172Q6VH22 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ift172Q6VH22 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ift172Q6VH22 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ift172Q6VH22 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ift172Q6VH22 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ift172Q6VH22 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Ift172Q6VH22 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Ift172Q6VH22 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ift172Q6VH22 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ift172Q6VH22 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Ift172Q6VH22 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Ift172Q6VH22 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ift172Q6VH22 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ift172Q6VH22 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ift172Q6VH22 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ift172Q6VH22 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Ift172Q6VH22 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Ift172Q6VH22 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ift172Q6VH22 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ift172Q6VH22 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ift172Q6VH22 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms