Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp8b3Q6UQ17 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp8b3Q6UQ17 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp8b3Q6UQ17 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp8b3Q6UQ17 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp8b3Q6UQ17 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp8b3Q6UQ17 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp8b3Q6UQ17 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp8b3Q6UQ17 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp8b3Q6UQ17 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp8b3Q6UQ17 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp8b3Q6UQ17 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp8b3Q6UQ17 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp8b3Q6UQ17 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp8b3Q6UQ17 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp8b3Q6UQ17 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp8b3Q6UQ17 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp8b3Q6UQ17 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp8b3Q6UQ17 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp8b3Q6UQ17 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp8b3Q6UQ17 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp8b3Q6UQ17 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp8b3Q6UQ17 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp8b3Q6UQ17 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp8b3Q6UQ17 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp8b3Q6UQ17 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp8b3Q6UQ17 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp8b3Q6UQ17 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp8b3Q6UQ17 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp8b3Q6UQ17 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp8b3Q6UQ17 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp8b3Q6UQ17 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp8b3Q6UQ17 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp8b3Q6UQ17 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp8b3Q6UQ17 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp8b3Q6UQ17 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp8b3Q6UQ17 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp8b3Q6UQ17 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp8b3Q6UQ17 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp8b3Q6UQ17 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp8b3Q6UQ17 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp8b3Q6UQ17 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp8b3Q6UQ17 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp8b3Q6UQ17 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp8b3Q6UQ17 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp8b3Q6UQ17 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp8b3Q6UQ17 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp8b3Q6UQ17 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp8b3Q6UQ17 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp8b3Q6UQ17 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp8b3Q6UQ17 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp8b3Q6UQ17 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp8b3Q6UQ17 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp8b3Q6UQ17 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp8b3Q6UQ17 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp8b3Q6UQ17 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Atp8b3Q6UQ17 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atp8b3Q6UQ17 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atp8b3Q6UQ17 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atp8b3Q6UQ17 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atp8b3Q6UQ17 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atp8b3Q6UQ17 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atp8b3Q6UQ17 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atp8b3Q6UQ17 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp8b3Q6UQ17 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp8b3Q6UQ17 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp8b3Q6UQ17 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp8b3Q6UQ17 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp8b3Q6UQ17 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp8b3Q6UQ17 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp8b3Q6UQ17 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp8b3Q6UQ17 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp8b3Q6UQ17 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp8b3Q6UQ17 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp8b3Q6UQ17 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp8b3Q6UQ17 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp8b3Q6UQ17 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp8b3Q6UQ17 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp8b3Q6UQ17 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp8b3Q6UQ17 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp8b3Q6UQ17 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp8b3Q6UQ17 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp8b3Q6UQ17 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp8b3Q6UQ17 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp8b3Q6UQ17 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp8b3Q6UQ17 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp8b3Q6UQ17 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp8b3Q6UQ17 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp8b3Q6UQ17 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp8b3Q6UQ17 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp8b3Q6UQ17 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp8b3Q6UQ17 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp8b3Q6UQ17 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp8b3Q6UQ17 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp8b3Q6UQ17 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp8b3Q6UQ17 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp8b3Q6UQ17 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp8b3Q6UQ17 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp8b3Q6UQ17 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp8b3Q6UQ17 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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