Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2P8

Neil2, Endonuclease 8-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neil2Q6R2P8 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Neil2Q6R2P8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Neil2Q6R2P8 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Neil2Q6R2P8 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Neil2Q6R2P8 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Neil2Q6R2P8 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Neil2Q6R2P8 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Neil2Q6R2P8 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Neil2Q6R2P8 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Neil2Q6R2P8 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Neil2Q6R2P8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Neil2Q6R2P8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Neil2Q6R2P8 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Neil2Q6R2P8 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Neil2Q6R2P8 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Neil2Q6R2P8 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Neil2Q6R2P8 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Neil2Q6R2P8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Neil2Q6R2P8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Neil2Q6R2P8 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Neil2Q6R2P8 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Neil2Q6R2P8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Neil2Q6R2P8 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Neil2Q6R2P8 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Neil2Q6R2P8 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Neil2Q6R2P8 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Neil2Q6R2P8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Neil2Q6R2P8 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Neil2Q6R2P8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Neil2Q6R2P8 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Neil2Q6R2P8 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Neil2Q6R2P8 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Neil2Q6R2P8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Neil2Q6R2P8 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Neil2Q6R2P8 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Neil2Q6R2P8 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Neil2Q6R2P8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Neil2Q6R2P8 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Neil2Q6R2P8 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Neil2Q6R2P8 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Neil2Q6R2P8 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Neil2Q6R2P8 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Neil2Q6R2P8 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Neil2Q6R2P8 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Neil2Q6R2P8 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Neil2Q6R2P8 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Neil2Q6R2P8 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Neil2Q6R2P8 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Neil2Q6R2P8 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Neil2Q6R2P8 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Neil2Q6R2P8 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Neil2Q6R2P8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Neil2Q6R2P8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms