Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHU5

Sort1, Sortilin, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sort1Q6PHU5 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sort1Q6PHU5 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sort1Q6PHU5 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sort1Q6PHU5 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sort1Q6PHU5 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sort1Q6PHU5 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sort1Q6PHU5 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sort1Q6PHU5 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sort1Q6PHU5 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sort1Q6PHU5 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Sort1Q6PHU5 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sort1Q6PHU5 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sort1Q6PHU5 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sort1Q6PHU5 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sort1Q6PHU5 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sort1Q6PHU5 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sort1Q6PHU5 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sort1Q6PHU5 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sort1Q6PHU5 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sort1Q6PHU5 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sort1Q6PHU5 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sort1Q6PHU5 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sort1Q6PHU5 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sort1Q6PHU5 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sort1Q6PHU5 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sort1Q6PHU5 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sort1Q6PHU5 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Sort1Q6PHU5 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sort1Q6PHU5 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sort1Q6PHU5 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sort1Q6PHU5 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sort1Q6PHU5 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Sort1Q6PHU5 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sort1Q6PHU5 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sort1Q6PHU5 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sort1Q6PHU5 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sort1Q6PHU5 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sort1Q6PHU5 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sort1Q6PHU5 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sort1Q6PHU5 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sort1Q6PHU5 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sort1Q6PHU5 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sort1Q6PHU5 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sort1Q6PHU5 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Sort1Q6PHU5 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Sort1Q6PHU5 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sort1Q6PHU5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sort1Q6PHU5 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sort1Q6PHU5 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sort1Q6PHU5 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sort1Q6PHU5 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sort1Q6PHU5 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sort1Q6PHU5 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sort1Q6PHU5 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sort1Q6PHU5 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sort1Q6PHU5 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sort1Q6PHU5 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sort1Q6PHU5 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sort1Q6PHU5 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sort1Q6PHU5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sort1Q6PHU5 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sort1Q6PHU5 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sort1Q6PHU5 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sort1Q6PHU5 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sort1Q6PHU5 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sort1Q6PHU5 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sort1Q6PHU5 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sort1Q6PHU5 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Sort1Q6PHU5 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sort1Q6PHU5 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sort1Q6PHU5 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sort1Q6PHU5 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sort1Q6PHU5 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sort1Q6PHU5 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sort1Q6PHU5 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sort1Q6PHU5 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sort1Q6PHU5 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sort1Q6PHU5 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sort1Q6PHU5 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sort1Q6PHU5 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sort1Q6PHU5 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sort1Q6PHU5 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sort1Q6PHU5 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sort1Q6PHU5 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sort1Q6PHU5 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Sort1Q6PHU5 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sort1Q6PHU5 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sort1Q6PHU5 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sort1Q6PHU5 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sort1Q6PHU5 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sort1Q6PHU5 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sort1Q6PHU5 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sort1Q6PHU5 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sort1Q6PHU5 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sort1Q6PHU5 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sort1Q6PHU5 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sort1Q6PHU5 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sort1Q6PHU5 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sort1Q6PHU5 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sort1Q6PHU5 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms