Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG16

Hjurp, Holliday junction recognition protein, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HjurpQ6PG16 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HjurpQ6PG16 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HjurpQ6PG16 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HjurpQ6PG16 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HjurpQ6PG16 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HjurpQ6PG16 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HjurpQ6PG16 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HjurpQ6PG16 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HjurpQ6PG16 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HjurpQ6PG16 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HjurpQ6PG16 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HjurpQ6PG16 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HjurpQ6PG16 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HjurpQ6PG16 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HjurpQ6PG16 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HjurpQ6PG16 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HjurpQ6PG16 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HjurpQ6PG16 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HjurpQ6PG16 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HjurpQ6PG16 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HjurpQ6PG16 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HjurpQ6PG16 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HjurpQ6PG16 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HjurpQ6PG16 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HjurpQ6PG16 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HjurpQ6PG16 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HjurpQ6PG16 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HjurpQ6PG16 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HjurpQ6PG16 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HjurpQ6PG16 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HjurpQ6PG16 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HjurpQ6PG16 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HjurpQ6PG16 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HjurpQ6PG16 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HjurpQ6PG16 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HjurpQ6PG16 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HjurpQ6PG16 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HjurpQ6PG16 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HjurpQ6PG16 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HjurpQ6PG16 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HjurpQ6PG16 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HjurpQ6PG16 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HjurpQ6PG16 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HjurpQ6PG16 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HjurpQ6PG16 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HjurpQ6PG16 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HjurpQ6PG16 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HjurpQ6PG16 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HjurpQ6PG16 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HjurpQ6PG16 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HjurpQ6PG16 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HjurpQ6PG16 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HjurpQ6PG16 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HjurpQ6PG16 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HjurpQ6PG16 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HjurpQ6PG16 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HjurpQ6PG16 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HjurpQ6PG16 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HjurpQ6PG16 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HjurpQ6PG16 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HjurpQ6PG16 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HjurpQ6PG16 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HjurpQ6PG16 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HjurpQ6PG16 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HjurpQ6PG16 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HjurpQ6PG16 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HjurpQ6PG16 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HjurpQ6PG16 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HjurpQ6PG16 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HjurpQ6PG16 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HjurpQ6PG16 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HjurpQ6PG16 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HjurpQ6PG16 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HjurpQ6PG16 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HjurpQ6PG16 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HjurpQ6PG16 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HjurpQ6PG16 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HjurpQ6PG16 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HjurpQ6PG16 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HjurpQ6PG16 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HjurpQ6PG16 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HjurpQ6PG16 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HjurpQ6PG16 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HjurpQ6PG16 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HjurpQ6PG16 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HjurpQ6PG16 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HjurpQ6PG16 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HjurpQ6PG16 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HjurpQ6PG16 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HjurpQ6PG16 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HjurpQ6PG16 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HjurpQ6PG16 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HjurpQ6PG16 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HjurpQ6PG16 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HjurpQ6PG16 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HjurpQ6PG16 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HjurpQ6PG16 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HjurpQ6PG16 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HjurpQ6PG16 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HjurpQ6PG16 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms