Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE01

Snrnp40, U5 small nuclear ribonucleoprotein 40 kDa protein, mousemouse

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Length 358 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp40Q6PE01 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrnp40Q6PE01 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrnp40Q6PE01 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrnp40Q6PE01 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrnp40Q6PE01 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snrnp40Q6PE01 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrnp40Q6PE01 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrnp40Q6PE01 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrnp40Q6PE01 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrnp40Q6PE01 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrnp40Q6PE01 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrnp40Q6PE01 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrnp40Q6PE01 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrnp40Q6PE01 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrnp40Q6PE01 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrnp40Q6PE01 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrnp40Q6PE01 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrnp40Q6PE01 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrnp40Q6PE01 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrnp40Q6PE01 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrnp40Q6PE01 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrnp40Q6PE01 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrnp40Q6PE01 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrnp40Q6PE01 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrnp40Q6PE01 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snrnp40Q6PE01 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snrnp40Q6PE01 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snrnp40Q6PE01 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snrnp40Q6PE01 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snrnp40Q6PE01 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snrnp40Q6PE01 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Snrnp40Q6PE01 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snrnp40Q6PE01 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snrnp40Q6PE01 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snrnp40Q6PE01 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snrnp40Q6PE01 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snrnp40Q6PE01 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snrnp40Q6PE01 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Snrnp40Q6PE01 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Snrnp40Q6PE01 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Snrnp40Q6PE01 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Snrnp40Q6PE01 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Snrnp40Q6PE01 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snrnp40Q6PE01 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snrnp40Q6PE01 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snrnp40Q6PE01 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snrnp40Q6PE01 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snrnp40Q6PE01 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snrnp40Q6PE01 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Snrnp40Q6PE01 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snrnp40Q6PE01 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snrnp40Q6PE01 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snrnp40Q6PE01 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snrnp40Q6PE01 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snrnp40Q6PE01 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snrnp40Q6PE01 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snrnp40Q6PE01 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snrnp40Q6PE01 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snrnp40Q6PE01 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrnp40Q6PE01 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrnp40Q6PE01 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrnp40Q6PE01 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrnp40Q6PE01 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrnp40Q6PE01 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrnp40Q6PE01 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrnp40Q6PE01 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrnp40Q6PE01 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrnp40Q6PE01 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrnp40Q6PE01 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrnp40Q6PE01 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrnp40Q6PE01 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrnp40Q6PE01 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrnp40Q6PE01 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrnp40Q6PE01 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrnp40Q6PE01 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrnp40Q6PE01 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrnp40Q6PE01 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrnp40Q6PE01 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrnp40Q6PE01 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrnp40Q6PE01 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrnp40Q6PE01 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snrnp40Q6PE01 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrnp40Q6PE01 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrnp40Q6PE01 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrnp40Q6PE01 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrnp40Q6PE01 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrnp40Q6PE01 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrnp40Q6PE01 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrnp40Q6PE01 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrnp40Q6PE01 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrnp40Q6PE01 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrnp40Q6PE01 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrnp40Q6PE01 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrnp40Q6PE01 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrnp40Q6PE01 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrnp40Q6PE01 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrnp40Q6PE01 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snrnp40Q6PE01 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrnp40Q6PE01 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snrnp40Q6PE01 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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