Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDZ2

Taf1c, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1cQ6PDZ2 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Taf1cQ6PDZ2 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Taf1cQ6PDZ2 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Taf1cQ6PDZ2 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Taf1cQ6PDZ2 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Taf1cQ6PDZ2 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Taf1cQ6PDZ2 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Taf1cQ6PDZ2 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Taf1cQ6PDZ2 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Taf1cQ6PDZ2 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Taf1cQ6PDZ2 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Taf1cQ6PDZ2 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Taf1cQ6PDZ2 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Taf1cQ6PDZ2 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf1cQ6PDZ2 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf1cQ6PDZ2 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf1cQ6PDZ2 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf1cQ6PDZ2 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf1cQ6PDZ2 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf1cQ6PDZ2 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf1cQ6PDZ2 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf1cQ6PDZ2 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf1cQ6PDZ2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf1cQ6PDZ2 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf1cQ6PDZ2 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf1cQ6PDZ2 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf1cQ6PDZ2 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf1cQ6PDZ2 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Taf1cQ6PDZ2 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Taf1cQ6PDZ2 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Taf1cQ6PDZ2 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Taf1cQ6PDZ2 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Taf1cQ6PDZ2 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Taf1cQ6PDZ2 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Taf1cQ6PDZ2 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Taf1cQ6PDZ2 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Taf1cQ6PDZ2 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Taf1cQ6PDZ2 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Taf1cQ6PDZ2 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Taf1cQ6PDZ2 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Taf1cQ6PDZ2 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Taf1cQ6PDZ2 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Taf1cQ6PDZ2 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Taf1cQ6PDZ2 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Taf1cQ6PDZ2 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Taf1cQ6PDZ2 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Taf1cQ6PDZ2 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Taf1cQ6PDZ2 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Taf1cQ6PDZ2 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Taf1cQ6PDZ2 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Taf1cQ6PDZ2 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Taf1cQ6PDZ2 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Taf1cQ6PDZ2 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Taf1cQ6PDZ2 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Taf1cQ6PDZ2 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Taf1cQ6PDZ2 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Taf1cQ6PDZ2 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Taf1cQ6PDZ2 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Taf1cQ6PDZ2 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Taf1cQ6PDZ2 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Taf1cQ6PDZ2 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Taf1cQ6PDZ2 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Taf1cQ6PDZ2 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Taf1cQ6PDZ2 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Taf1cQ6PDZ2 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Taf1cQ6PDZ2 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf1cQ6PDZ2 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf1cQ6PDZ2 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf1cQ6PDZ2 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf1cQ6PDZ2 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf1cQ6PDZ2 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf1cQ6PDZ2 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf1cQ6PDZ2 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf1cQ6PDZ2 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf1cQ6PDZ2 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf1cQ6PDZ2 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf1cQ6PDZ2 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf1cQ6PDZ2 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf1cQ6PDZ2 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf1cQ6PDZ2 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Taf1cQ6PDZ2 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf1cQ6PDZ2 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf1cQ6PDZ2 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf1cQ6PDZ2 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf1cQ6PDZ2 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf1cQ6PDZ2 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf1cQ6PDZ2 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf1cQ6PDZ2 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf1cQ6PDZ2 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf1cQ6PDZ2 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf1cQ6PDZ2 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf1cQ6PDZ2 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf1cQ6PDZ2 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf1cQ6PDZ2 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf1cQ6PDZ2 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf1cQ6PDZ2 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Taf1cQ6PDZ2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Taf1cQ6PDZ2 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Taf1cQ6PDZ2 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Taf1cQ6PDZ2 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms